Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULK4

MED23, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 23, humanhuman

Predictions only

Length 1,368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED23Q9ULK4 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MED23Q9ULK4 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
MED23Q9ULK4 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
MED23Q9ULK4 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
MED23Q9ULK4 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MED23Q9ULK4 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MED23Q9ULK4 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MED23Q9ULK4 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MED23Q9ULK4 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MED23Q9ULK4 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MED23Q9ULK4 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MED23Q9ULK4 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MED23Q9ULK4 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MED23Q9ULK4 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MED23Q9ULK4 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MED23Q9ULK4 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MED23Q9ULK4 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MED23Q9ULK4 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MED23Q9ULK4 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MED23Q9ULK4 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
MED23Q9ULK4 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MED23Q9ULK4 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MED23Q9ULK4 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MED23Q9ULK4 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MED23Q9ULK4 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MED23Q9ULK4 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MED23Q9ULK4 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
MED23Q9ULK4 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MED23Q9ULK4 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MED23Q9ULK4 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MED23Q9ULK4 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MED23Q9ULK4 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MED23Q9ULK4 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MED23Q9ULK4 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MED23Q9ULK4 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MED23Q9ULK4 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MED23Q9ULK4 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MED23Q9ULK4 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MED23Q9ULK4 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
MED23Q9ULK4 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
MED23Q9ULK4 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MED23Q9ULK4 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MED23Q9ULK4 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MED23Q9ULK4 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MED23Q9ULK4 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MED23Q9ULK4 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MED23Q9ULK4 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MED23Q9ULK4 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MED23Q9ULK4 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
MED23Q9ULK4 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MED23Q9ULK4 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MED23Q9ULK4 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MED23Q9ULK4 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
MED23Q9ULK4 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
MED23Q9ULK4 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MED23Q9ULK4 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MED23Q9ULK4 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MED23Q9ULK4 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MED23Q9ULK4 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MED23Q9ULK4 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
MED23Q9ULK4 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MED23Q9ULK4 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MED23Q9ULK4 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MED23Q9ULK4 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MED23Q9ULK4 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MED23Q9ULK4 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MED23Q9ULK4 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MED23Q9ULK4 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
MED23Q9ULK4 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MED23Q9ULK4 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MED23Q9ULK4 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
MED23Q9ULK4 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MED23Q9ULK4 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MED23Q9ULK4 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MED23Q9ULK4 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MED23Q9ULK4 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MED23Q9ULK4 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MED23Q9ULK4 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MED23Q9ULK4 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MED23Q9ULK4 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MED23Q9ULK4 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MED23Q9ULK4 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MED23Q9ULK4 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MED23Q9ULK4 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MED23Q9ULK4 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MED23Q9ULK4 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MED23Q9ULK4 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MED23Q9ULK4 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MED23Q9ULK4 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MED23Q9ULK4 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MED23Q9ULK4 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
MED23Q9ULK4 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
MED23Q9ULK4 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MED23Q9ULK4 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MED23Q9ULK4 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MED23Q9ULK4 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MED23Q9ULK4 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MED23Q9ULK4 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MED23Q9ULK4 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MED23Q9ULK4 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms