Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKJ5

CHIC2, Cysteine-rich hydrophobic domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHIC2Q9UKJ5 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CHIC2Q9UKJ5 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
CHIC2Q9UKJ5 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CHIC2Q9UKJ5 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CHIC2Q9UKJ5 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CHIC2Q9UKJ5 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CHIC2Q9UKJ5 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CHIC2Q9UKJ5 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CHIC2Q9UKJ5 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CHIC2Q9UKJ5 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CHIC2Q9UKJ5 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CHIC2Q9UKJ5 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CHIC2Q9UKJ5 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CHIC2Q9UKJ5 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CHIC2Q9UKJ5 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CHIC2Q9UKJ5 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CHIC2Q9UKJ5 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CHIC2Q9UKJ5 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
CHIC2Q9UKJ5 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CHIC2Q9UKJ5 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CHIC2Q9UKJ5 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CHIC2Q9UKJ5 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CHIC2Q9UKJ5 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CHIC2Q9UKJ5 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CHIC2Q9UKJ5 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CHIC2Q9UKJ5 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CHIC2Q9UKJ5 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CHIC2Q9UKJ5 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CHIC2Q9UKJ5 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
CHIC2Q9UKJ5 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CHIC2Q9UKJ5 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CHIC2Q9UKJ5 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CHIC2Q9UKJ5 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
CHIC2Q9UKJ5 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CHIC2Q9UKJ5 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CHIC2Q9UKJ5 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CHIC2Q9UKJ5 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CHIC2Q9UKJ5 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CHIC2Q9UKJ5 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CHIC2Q9UKJ5 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CHIC2Q9UKJ5 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CHIC2Q9UKJ5 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CHIC2Q9UKJ5 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CHIC2Q9UKJ5 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CHIC2Q9UKJ5 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CHIC2Q9UKJ5 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CHIC2Q9UKJ5 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CHIC2Q9UKJ5 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
CHIC2Q9UKJ5 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CHIC2Q9UKJ5 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CHIC2Q9UKJ5 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CHIC2Q9UKJ5 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CHIC2Q9UKJ5 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CHIC2Q9UKJ5 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CHIC2Q9UKJ5 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CHIC2Q9UKJ5 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CHIC2Q9UKJ5 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CHIC2Q9UKJ5 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CHIC2Q9UKJ5 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CHIC2Q9UKJ5 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CHIC2Q9UKJ5 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CHIC2Q9UKJ5 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
CHIC2Q9UKJ5 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CHIC2Q9UKJ5 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CHIC2Q9UKJ5 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CHIC2Q9UKJ5 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CHIC2Q9UKJ5 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
CHIC2Q9UKJ5 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CHIC2Q9UKJ5 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CHIC2Q9UKJ5 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CHIC2Q9UKJ5 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CHIC2Q9UKJ5 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CHIC2Q9UKJ5 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CHIC2Q9UKJ5 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CHIC2Q9UKJ5 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
CHIC2Q9UKJ5 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CHIC2Q9UKJ5 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CHIC2Q9UKJ5 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CHIC2Q9UKJ5 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CHIC2Q9UKJ5 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CHIC2Q9UKJ5 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CHIC2Q9UKJ5 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CHIC2Q9UKJ5 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
CHIC2Q9UKJ5 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CHIC2Q9UKJ5 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CHIC2Q9UKJ5 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CHIC2Q9UKJ5 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CHIC2Q9UKJ5 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CHIC2Q9UKJ5 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CHIC2Q9UKJ5 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CHIC2Q9UKJ5 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CHIC2Q9UKJ5 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CHIC2Q9UKJ5 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CHIC2Q9UKJ5 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CHIC2Q9UKJ5 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CHIC2Q9UKJ5 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CHIC2Q9UKJ5 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CHIC2Q9UKJ5 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CHIC2Q9UKJ5 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CHIC2Q9UKJ5 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms