Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKI2

CDC42EP3, Cdc42 effector protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP3Q9UKI2 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDC42EP3Q9UKI2 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDC42EP3Q9UKI2 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDC42EP3Q9UKI2 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CDC42EP3Q9UKI2 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDC42EP3Q9UKI2 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDC42EP3Q9UKI2 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDC42EP3Q9UKI2 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDC42EP3Q9UKI2 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDC42EP3Q9UKI2 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDC42EP3Q9UKI2 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDC42EP3Q9UKI2 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDC42EP3Q9UKI2 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDC42EP3Q9UKI2 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDC42EP3Q9UKI2 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDC42EP3Q9UKI2 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDC42EP3Q9UKI2 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDC42EP3Q9UKI2 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDC42EP3Q9UKI2 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDC42EP3Q9UKI2 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDC42EP3Q9UKI2 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDC42EP3Q9UKI2 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDC42EP3Q9UKI2 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDC42EP3Q9UKI2 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CDC42EP3Q9UKI2 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDC42EP3Q9UKI2 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDC42EP3Q9UKI2 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDC42EP3Q9UKI2 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDC42EP3Q9UKI2 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDC42EP3Q9UKI2 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDC42EP3Q9UKI2 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDC42EP3Q9UKI2 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDC42EP3Q9UKI2 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CDC42EP3Q9UKI2 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDC42EP3Q9UKI2 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CDC42EP3Q9UKI2 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDC42EP3Q9UKI2 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDC42EP3Q9UKI2 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDC42EP3Q9UKI2 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDC42EP3Q9UKI2 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDC42EP3Q9UKI2 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDC42EP3Q9UKI2 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDC42EP3Q9UKI2 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDC42EP3Q9UKI2 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDC42EP3Q9UKI2 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDC42EP3Q9UKI2 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDC42EP3Q9UKI2 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDC42EP3Q9UKI2 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDC42EP3Q9UKI2 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDC42EP3Q9UKI2 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDC42EP3Q9UKI2 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDC42EP3Q9UKI2 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDC42EP3Q9UKI2 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDC42EP3Q9UKI2 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDC42EP3Q9UKI2 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDC42EP3Q9UKI2 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDC42EP3Q9UKI2 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CDC42EP3Q9UKI2 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CDC42EP3Q9UKI2 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDC42EP3Q9UKI2 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDC42EP3Q9UKI2 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDC42EP3Q9UKI2 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDC42EP3Q9UKI2 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDC42EP3Q9UKI2 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDC42EP3Q9UKI2 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDC42EP3Q9UKI2 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDC42EP3Q9UKI2 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDC42EP3Q9UKI2 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDC42EP3Q9UKI2 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDC42EP3Q9UKI2 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDC42EP3Q9UKI2 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDC42EP3Q9UKI2 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDC42EP3Q9UKI2 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDC42EP3Q9UKI2 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDC42EP3Q9UKI2 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDC42EP3Q9UKI2 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDC42EP3Q9UKI2 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDC42EP3Q9UKI2 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDC42EP3Q9UKI2 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDC42EP3Q9UKI2 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDC42EP3Q9UKI2 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CDC42EP3Q9UKI2 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDC42EP3Q9UKI2 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDC42EP3Q9UKI2 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDC42EP3Q9UKI2 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDC42EP3Q9UKI2 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CDC42EP3Q9UKI2 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDC42EP3Q9UKI2 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDC42EP3Q9UKI2 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDC42EP3Q9UKI2 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDC42EP3Q9UKI2 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDC42EP3Q9UKI2 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDC42EP3Q9UKI2 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDC42EP3Q9UKI2 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDC42EP3Q9UKI2 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDC42EP3Q9UKI2 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDC42EP3Q9UKI2 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDC42EP3Q9UKI2 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDC42EP3Q9UKI2 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CDC42EP3Q9UKI2 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms