Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJJ7

RPUSD1, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD1Q9UJJ7 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPUSD1Q9UJJ7 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPUSD1Q9UJJ7 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPUSD1Q9UJJ7 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RPUSD1Q9UJJ7 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RPUSD1Q9UJJ7 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RPUSD1Q9UJJ7 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RPUSD1Q9UJJ7 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RPUSD1Q9UJJ7 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RPUSD1Q9UJJ7 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RPUSD1Q9UJJ7 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RPUSD1Q9UJJ7 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RPUSD1Q9UJJ7 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RPUSD1Q9UJJ7 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RPUSD1Q9UJJ7 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPUSD1Q9UJJ7 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPUSD1Q9UJJ7 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPUSD1Q9UJJ7 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPUSD1Q9UJJ7 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPUSD1Q9UJJ7 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPUSD1Q9UJJ7 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPUSD1Q9UJJ7 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPUSD1Q9UJJ7 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPUSD1Q9UJJ7 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPUSD1Q9UJJ7 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPUSD1Q9UJJ7 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPUSD1Q9UJJ7 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPUSD1Q9UJJ7 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPUSD1Q9UJJ7 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPUSD1Q9UJJ7 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPUSD1Q9UJJ7 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPUSD1Q9UJJ7 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPUSD1Q9UJJ7 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RPUSD1Q9UJJ7 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RPUSD1Q9UJJ7 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPUSD1Q9UJJ7 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPUSD1Q9UJJ7 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPUSD1Q9UJJ7 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPUSD1Q9UJJ7 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPUSD1Q9UJJ7 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPUSD1Q9UJJ7 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RPUSD1Q9UJJ7 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPUSD1Q9UJJ7 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RPUSD1Q9UJJ7 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPUSD1Q9UJJ7 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPUSD1Q9UJJ7 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPUSD1Q9UJJ7 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPUSD1Q9UJJ7 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPUSD1Q9UJJ7 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPUSD1Q9UJJ7 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RPUSD1Q9UJJ7 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPUSD1Q9UJJ7 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPUSD1Q9UJJ7 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPUSD1Q9UJJ7 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPUSD1Q9UJJ7 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPUSD1Q9UJJ7 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RPUSD1Q9UJJ7 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPUSD1Q9UJJ7 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPUSD1Q9UJJ7 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RPUSD1Q9UJJ7 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPUSD1Q9UJJ7 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RPUSD1Q9UJJ7 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPUSD1Q9UJJ7 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPUSD1Q9UJJ7 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPUSD1Q9UJJ7 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPUSD1Q9UJJ7 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RPUSD1Q9UJJ7 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RPUSD1Q9UJJ7 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPUSD1Q9UJJ7 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPUSD1Q9UJJ7 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPUSD1Q9UJJ7 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPUSD1Q9UJJ7 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPUSD1Q9UJJ7 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPUSD1Q9UJJ7 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPUSD1Q9UJJ7 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPUSD1Q9UJJ7 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPUSD1Q9UJJ7 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPUSD1Q9UJJ7 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPUSD1Q9UJJ7 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPUSD1Q9UJJ7 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPUSD1Q9UJJ7 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPUSD1Q9UJJ7 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPUSD1Q9UJJ7 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPUSD1Q9UJJ7 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPUSD1Q9UJJ7 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPUSD1Q9UJJ7 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPUSD1Q9UJJ7 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPUSD1Q9UJJ7 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPUSD1Q9UJJ7 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPUSD1Q9UJJ7 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPUSD1Q9UJJ7 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPUSD1Q9UJJ7 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPUSD1Q9UJJ7 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPUSD1Q9UJJ7 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPUSD1Q9UJJ7 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPUSD1Q9UJJ7 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPUSD1Q9UJJ7 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPUSD1Q9UJJ7 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPUSD1Q9UJJ7 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPUSD1Q9UJJ7 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
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