Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIS9

MBD1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD1Q9UIS9 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MBD1Q9UIS9 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
MBD1Q9UIS9 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
MBD1Q9UIS9 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
MBD1Q9UIS9 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MBD1Q9UIS9 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
MBD1Q9UIS9 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
MBD1Q9UIS9 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
MBD1Q9UIS9 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MBD1Q9UIS9 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
MBD1Q9UIS9 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
MBD1Q9UIS9 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
MBD1Q9UIS9 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
MBD1Q9UIS9 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
MBD1Q9UIS9 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MBD1Q9UIS9 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
MBD1Q9UIS9 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
MBD1Q9UIS9 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
MBD1Q9UIS9 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MBD1Q9UIS9 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
MBD1Q9UIS9 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
MBD1Q9UIS9 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MBD1Q9UIS9 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MBD1Q9UIS9 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MBD1Q9UIS9 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
MBD1Q9UIS9 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
MBD1Q9UIS9 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
MBD1Q9UIS9 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
MBD1Q9UIS9 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
MBD1Q9UIS9 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
MBD1Q9UIS9 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MBD1Q9UIS9 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MBD1Q9UIS9 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MBD1Q9UIS9 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MBD1Q9UIS9 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MBD1Q9UIS9 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MBD1Q9UIS9 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
MBD1Q9UIS9 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MBD1Q9UIS9 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MBD1Q9UIS9 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MBD1Q9UIS9 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MBD1Q9UIS9 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MBD1Q9UIS9 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
MBD1Q9UIS9 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MBD1Q9UIS9 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MBD1Q9UIS9 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MBD1Q9UIS9 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MBD1Q9UIS9 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MBD1Q9UIS9 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MBD1Q9UIS9 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MBD1Q9UIS9 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MBD1Q9UIS9 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
MBD1Q9UIS9 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MBD1Q9UIS9 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MBD1Q9UIS9 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MBD1Q9UIS9 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MBD1Q9UIS9 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MBD1Q9UIS9 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MBD1Q9UIS9 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MBD1Q9UIS9 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MBD1Q9UIS9 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MBD1Q9UIS9 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MBD1Q9UIS9 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MBD1Q9UIS9 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MBD1Q9UIS9 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MBD1Q9UIS9 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MBD1Q9UIS9 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MBD1Q9UIS9 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MBD1Q9UIS9 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MBD1Q9UIS9 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
MBD1Q9UIS9 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MBD1Q9UIS9 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MBD1Q9UIS9 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
MBD1Q9UIS9 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MBD1Q9UIS9 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MBD1Q9UIS9 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MBD1Q9UIS9 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MBD1Q9UIS9 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MBD1Q9UIS9 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MBD1Q9UIS9 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
MBD1Q9UIS9 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MBD1Q9UIS9 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MBD1Q9UIS9 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MBD1Q9UIS9 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MBD1Q9UIS9 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
MBD1Q9UIS9 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MBD1Q9UIS9 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MBD1Q9UIS9 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MBD1Q9UIS9 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MBD1Q9UIS9 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MBD1Q9UIS9 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MBD1Q9UIS9 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MBD1Q9UIS9 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MBD1Q9UIS9 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MBD1Q9UIS9 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
MBD1Q9UIS9 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MBD1Q9UIS9 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MBD1Q9UIS9 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MBD1Q9UIS9 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MBD1Q9UIS9 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms