Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHX1

PUF60, Poly(U)-binding-splicing factor PUF60, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUF60Q9UHX1 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PUF60Q9UHX1 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PUF60Q9UHX1 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PUF60Q9UHX1 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PUF60Q9UHX1 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PUF60Q9UHX1 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PUF60Q9UHX1 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PUF60Q9UHX1 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PUF60Q9UHX1 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PUF60Q9UHX1 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PUF60Q9UHX1 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PUF60Q9UHX1 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PUF60Q9UHX1 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PUF60Q9UHX1 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PUF60Q9UHX1 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PUF60Q9UHX1 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PUF60Q9UHX1 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PUF60Q9UHX1 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PUF60Q9UHX1 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PUF60Q9UHX1 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PUF60Q9UHX1 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PUF60Q9UHX1 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PUF60Q9UHX1 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PUF60Q9UHX1 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PUF60Q9UHX1 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PUF60Q9UHX1 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PUF60Q9UHX1 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PUF60Q9UHX1 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PUF60Q9UHX1 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PUF60Q9UHX1 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PUF60Q9UHX1 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PUF60Q9UHX1 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PUF60Q9UHX1 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PUF60Q9UHX1 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PUF60Q9UHX1 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PUF60Q9UHX1 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PUF60Q9UHX1 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PUF60Q9UHX1 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PUF60Q9UHX1 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PUF60Q9UHX1 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PUF60Q9UHX1 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PUF60Q9UHX1 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PUF60Q9UHX1 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PUF60Q9UHX1 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PUF60Q9UHX1 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PUF60Q9UHX1 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PUF60Q9UHX1 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PUF60Q9UHX1 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PUF60Q9UHX1 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PUF60Q9UHX1 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PUF60Q9UHX1 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PUF60Q9UHX1 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PUF60Q9UHX1 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PUF60Q9UHX1 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PUF60Q9UHX1 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PUF60Q9UHX1 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PUF60Q9UHX1 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PUF60Q9UHX1 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PUF60Q9UHX1 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PUF60Q9UHX1 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PUF60Q9UHX1 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PUF60Q9UHX1 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PUF60Q9UHX1 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PUF60Q9UHX1 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PUF60Q9UHX1 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PUF60Q9UHX1 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PUF60Q9UHX1 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PUF60Q9UHX1 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PUF60Q9UHX1 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PUF60Q9UHX1 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PUF60Q9UHX1 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PUF60Q9UHX1 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PUF60Q9UHX1 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PUF60Q9UHX1 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PUF60Q9UHX1 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PUF60Q9UHX1 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PUF60Q9UHX1 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PUF60Q9UHX1 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PUF60Q9UHX1 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PUF60Q9UHX1 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PUF60Q9UHX1 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PUF60Q9UHX1 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PUF60Q9UHX1 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
PUF60Q9UHX1 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PUF60Q9UHX1 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PUF60Q9UHX1 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PUF60Q9UHX1 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PUF60Q9UHX1 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PUF60Q9UHX1 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PUF60Q9UHX1 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PUF60Q9UHX1 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PUF60Q9UHX1 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PUF60Q9UHX1 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PUF60Q9UHX1 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PUF60Q9UHX1 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PUF60Q9UHX1 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PUF60Q9UHX1 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PUF60Q9UHX1 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PUF60Q9UHX1 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PUF60Q9UHX1 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms