Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH65

SWAP70, Switch-associated protein 70, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SWAP70Q9UH65 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SWAP70Q9UH65 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SWAP70Q9UH65 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SWAP70Q9UH65 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SWAP70Q9UH65 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SWAP70Q9UH65 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SWAP70Q9UH65 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SWAP70Q9UH65 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SWAP70Q9UH65 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SWAP70Q9UH65 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SWAP70Q9UH65 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SWAP70Q9UH65 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SWAP70Q9UH65 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SWAP70Q9UH65 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SWAP70Q9UH65 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SWAP70Q9UH65 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SWAP70Q9UH65 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SWAP70Q9UH65 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SWAP70Q9UH65 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SWAP70Q9UH65 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SWAP70Q9UH65 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SWAP70Q9UH65 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SWAP70Q9UH65 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SWAP70Q9UH65 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SWAP70Q9UH65 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SWAP70Q9UH65 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SWAP70Q9UH65 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SWAP70Q9UH65 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SWAP70Q9UH65 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SWAP70Q9UH65 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SWAP70Q9UH65 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SWAP70Q9UH65 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SWAP70Q9UH65 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SWAP70Q9UH65 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SWAP70Q9UH65 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SWAP70Q9UH65 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SWAP70Q9UH65 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SWAP70Q9UH65 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SWAP70Q9UH65 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SWAP70Q9UH65 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SWAP70Q9UH65 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SWAP70Q9UH65 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SWAP70Q9UH65 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SWAP70Q9UH65 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SWAP70Q9UH65 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SWAP70Q9UH65 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SWAP70Q9UH65 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SWAP70Q9UH65 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SWAP70Q9UH65 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SWAP70Q9UH65 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SWAP70Q9UH65 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SWAP70Q9UH65 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SWAP70Q9UH65 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SWAP70Q9UH65 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SWAP70Q9UH65 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SWAP70Q9UH65 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SWAP70Q9UH65 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SWAP70Q9UH65 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SWAP70Q9UH65 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SWAP70Q9UH65 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SWAP70Q9UH65 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SWAP70Q9UH65 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SWAP70Q9UH65 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SWAP70Q9UH65 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SWAP70Q9UH65 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SWAP70Q9UH65 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SWAP70Q9UH65 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SWAP70Q9UH65 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SWAP70Q9UH65 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SWAP70Q9UH65 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SWAP70Q9UH65 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SWAP70Q9UH65 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SWAP70Q9UH65 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SWAP70Q9UH65 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SWAP70Q9UH65 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SWAP70Q9UH65 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SWAP70Q9UH65 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SWAP70Q9UH65 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SWAP70Q9UH65 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SWAP70Q9UH65 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SWAP70Q9UH65 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SWAP70Q9UH65 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SWAP70Q9UH65 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SWAP70Q9UH65 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SWAP70Q9UH65 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SWAP70Q9UH65 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SWAP70Q9UH65 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SWAP70Q9UH65 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SWAP70Q9UH65 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SWAP70Q9UH65 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SWAP70Q9UH65 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SWAP70Q9UH65 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SWAP70Q9UH65 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SWAP70Q9UH65 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SWAP70Q9UH65 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SWAP70Q9UH65 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SWAP70Q9UH65 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SWAP70Q9UH65 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SWAP70Q9UH65 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SWAP70Q9UH65 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms