Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBZ4

APEX2, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase 2, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APEX2Q9UBZ4 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
APEX2Q9UBZ4 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
APEX2Q9UBZ4 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
APEX2Q9UBZ4 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
APEX2Q9UBZ4 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
APEX2Q9UBZ4 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
APEX2Q9UBZ4 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
APEX2Q9UBZ4 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
APEX2Q9UBZ4 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
APEX2Q9UBZ4 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
APEX2Q9UBZ4 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
APEX2Q9UBZ4 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
APEX2Q9UBZ4 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
APEX2Q9UBZ4 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
APEX2Q9UBZ4 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
APEX2Q9UBZ4 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
APEX2Q9UBZ4 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
APEX2Q9UBZ4 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
APEX2Q9UBZ4 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
APEX2Q9UBZ4 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
APEX2Q9UBZ4 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
APEX2Q9UBZ4 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
APEX2Q9UBZ4 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
APEX2Q9UBZ4 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
APEX2Q9UBZ4 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
APEX2Q9UBZ4 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
APEX2Q9UBZ4 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
APEX2Q9UBZ4 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
APEX2Q9UBZ4 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
APEX2Q9UBZ4 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
APEX2Q9UBZ4 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
APEX2Q9UBZ4 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
APEX2Q9UBZ4 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
APEX2Q9UBZ4 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
APEX2Q9UBZ4 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
APEX2Q9UBZ4 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
APEX2Q9UBZ4 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
APEX2Q9UBZ4 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
APEX2Q9UBZ4 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
APEX2Q9UBZ4 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
APEX2Q9UBZ4 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
APEX2Q9UBZ4 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
APEX2Q9UBZ4 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
APEX2Q9UBZ4 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
APEX2Q9UBZ4 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
APEX2Q9UBZ4 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
APEX2Q9UBZ4 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
APEX2Q9UBZ4 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
APEX2Q9UBZ4 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
APEX2Q9UBZ4 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
APEX2Q9UBZ4 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
APEX2Q9UBZ4 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
APEX2Q9UBZ4 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
APEX2Q9UBZ4 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
APEX2Q9UBZ4 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
APEX2Q9UBZ4 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
APEX2Q9UBZ4 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
APEX2Q9UBZ4 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
APEX2Q9UBZ4 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
APEX2Q9UBZ4 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
APEX2Q9UBZ4 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
APEX2Q9UBZ4 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
APEX2Q9UBZ4 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
APEX2Q9UBZ4 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
APEX2Q9UBZ4 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
APEX2Q9UBZ4 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
APEX2Q9UBZ4 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
APEX2Q9UBZ4 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
APEX2Q9UBZ4 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
APEX2Q9UBZ4 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
APEX2Q9UBZ4 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
APEX2Q9UBZ4 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
APEX2Q9UBZ4 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
APEX2Q9UBZ4 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
APEX2Q9UBZ4 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
APEX2Q9UBZ4 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
APEX2Q9UBZ4 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
APEX2Q9UBZ4 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
APEX2Q9UBZ4 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
APEX2Q9UBZ4 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
APEX2Q9UBZ4 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
APEX2Q9UBZ4 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
APEX2Q9UBZ4 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
APEX2Q9UBZ4 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
APEX2Q9UBZ4 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
APEX2Q9UBZ4 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
APEX2Q9UBZ4 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
APEX2Q9UBZ4 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
APEX2Q9UBZ4 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
APEX2Q9UBZ4 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
APEX2Q9UBZ4 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
APEX2Q9UBZ4 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
APEX2Q9UBZ4 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
APEX2Q9UBZ4 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
APEX2Q9UBZ4 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
APEX2Q9UBZ4 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
APEX2Q9UBZ4 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
APEX2Q9UBZ4 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
APEX2Q9UBZ4 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
APEX2Q9UBZ4 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms