Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT6

POLK, DNA polymerase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLKQ9UBT6 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
POLKQ9UBT6 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
POLKQ9UBT6 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
POLKQ9UBT6 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
POLKQ9UBT6 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
POLKQ9UBT6 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
POLKQ9UBT6 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
POLKQ9UBT6 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
POLKQ9UBT6 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
POLKQ9UBT6 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
POLKQ9UBT6 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
POLKQ9UBT6 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
POLKQ9UBT6 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
POLKQ9UBT6 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
POLKQ9UBT6 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
POLKQ9UBT6 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
POLKQ9UBT6 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
POLKQ9UBT6 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
POLKQ9UBT6 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
POLKQ9UBT6 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
POLKQ9UBT6 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
POLKQ9UBT6 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
POLKQ9UBT6 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
POLKQ9UBT6 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
POLKQ9UBT6 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
POLKQ9UBT6 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
POLKQ9UBT6 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
POLKQ9UBT6 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
POLKQ9UBT6 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
POLKQ9UBT6 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
POLKQ9UBT6 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
POLKQ9UBT6 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
POLKQ9UBT6 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
POLKQ9UBT6 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
POLKQ9UBT6 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
POLKQ9UBT6 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
POLKQ9UBT6 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
POLKQ9UBT6 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
POLKQ9UBT6 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
POLKQ9UBT6 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
POLKQ9UBT6 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
POLKQ9UBT6 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
POLKQ9UBT6 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
POLKQ9UBT6 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
POLKQ9UBT6 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
POLKQ9UBT6 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
POLKQ9UBT6 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
POLKQ9UBT6 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
POLKQ9UBT6 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
POLKQ9UBT6 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
POLKQ9UBT6 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
POLKQ9UBT6 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
POLKQ9UBT6 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
POLKQ9UBT6 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
POLKQ9UBT6 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
POLKQ9UBT6 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
POLKQ9UBT6 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
POLKQ9UBT6 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
POLKQ9UBT6 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
POLKQ9UBT6 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
POLKQ9UBT6 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
POLKQ9UBT6 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
POLKQ9UBT6 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
POLKQ9UBT6 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
POLKQ9UBT6 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
POLKQ9UBT6 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
POLKQ9UBT6 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
POLKQ9UBT6 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
POLKQ9UBT6 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
POLKQ9UBT6 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
POLKQ9UBT6 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
POLKQ9UBT6 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
POLKQ9UBT6 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
POLKQ9UBT6 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
POLKQ9UBT6 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
POLKQ9UBT6 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
POLKQ9UBT6 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
POLKQ9UBT6 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
POLKQ9UBT6 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
POLKQ9UBT6 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
POLKQ9UBT6 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
POLKQ9UBT6 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
POLKQ9UBT6 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
POLKQ9UBT6 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
POLKQ9UBT6 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
POLKQ9UBT6 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
POLKQ9UBT6 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
POLKQ9UBT6 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
POLKQ9UBT6 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
POLKQ9UBT6 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
POLKQ9UBT6 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
POLKQ9UBT6 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
POLKQ9UBT6 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
POLKQ9UBT6 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
POLKQ9UBT6 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
POLKQ9UBT6 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
POLKQ9UBT6 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
POLKQ9UBT6 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
POLKQ9UBT6 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
POLKQ9UBT6 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms