Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2X0

DPM3, Dolichol-phosphate mannosyltransferase subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DPM3Q9P2X0 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DPM3Q9P2X0 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DPM3Q9P2X0 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DPM3Q9P2X0 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DPM3Q9P2X0 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DPM3Q9P2X0 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DPM3Q9P2X0 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DPM3Q9P2X0 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DPM3Q9P2X0 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DPM3Q9P2X0 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DPM3Q9P2X0 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DPM3Q9P2X0 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DPM3Q9P2X0 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DPM3Q9P2X0 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DPM3Q9P2X0 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DPM3Q9P2X0 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DPM3Q9P2X0 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DPM3Q9P2X0 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DPM3Q9P2X0 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DPM3Q9P2X0 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
DPM3Q9P2X0 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DPM3Q9P2X0 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DPM3Q9P2X0 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DPM3Q9P2X0 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
DPM3Q9P2X0 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DPM3Q9P2X0 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DPM3Q9P2X0 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DPM3Q9P2X0 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DPM3Q9P2X0 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DPM3Q9P2X0 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DPM3Q9P2X0 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DPM3Q9P2X0 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DPM3Q9P2X0 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DPM3Q9P2X0 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DPM3Q9P2X0 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DPM3Q9P2X0 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DPM3Q9P2X0 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DPM3Q9P2X0 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DPM3Q9P2X0 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DPM3Q9P2X0 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DPM3Q9P2X0 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DPM3Q9P2X0 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DPM3Q9P2X0 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DPM3Q9P2X0 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DPM3Q9P2X0 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DPM3Q9P2X0 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DPM3Q9P2X0 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DPM3Q9P2X0 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DPM3Q9P2X0 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DPM3Q9P2X0 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DPM3Q9P2X0 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DPM3Q9P2X0 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DPM3Q9P2X0 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DPM3Q9P2X0 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DPM3Q9P2X0 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DPM3Q9P2X0 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DPM3Q9P2X0 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DPM3Q9P2X0 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
DPM3Q9P2X0 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DPM3Q9P2X0 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DPM3Q9P2X0 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DPM3Q9P2X0 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DPM3Q9P2X0 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DPM3Q9P2X0 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DPM3Q9P2X0 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DPM3Q9P2X0 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DPM3Q9P2X0 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
DPM3Q9P2X0 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DPM3Q9P2X0 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DPM3Q9P2X0 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DPM3Q9P2X0 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DPM3Q9P2X0 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DPM3Q9P2X0 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DPM3Q9P2X0 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DPM3Q9P2X0 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DPM3Q9P2X0 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DPM3Q9P2X0 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DPM3Q9P2X0 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DPM3Q9P2X0 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DPM3Q9P2X0 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DPM3Q9P2X0 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DPM3Q9P2X0 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DPM3Q9P2X0 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DPM3Q9P2X0 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DPM3Q9P2X0 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DPM3Q9P2X0 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DPM3Q9P2X0 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DPM3Q9P2X0 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
DPM3Q9P2X0 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DPM3Q9P2X0 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
DPM3Q9P2X0 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DPM3Q9P2X0 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DPM3Q9P2X0 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DPM3Q9P2X0 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DPM3Q9P2X0 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DPM3Q9P2X0 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DPM3Q9P2X0 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DPM3Q9P2X0 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DPM3Q9P2X0 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DPM3Q9P2X0 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms