Protein–RNA interactions for Protein: Q9P267

MBD5, Methyl-CpG-binding domain protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,494 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD5Q9P267 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
MBD5Q9P267 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
MBD5Q9P267 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
MBD5Q9P267 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
MBD5Q9P267 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
MBD5Q9P267 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
MBD5Q9P267 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
MBD5Q9P267 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC28.48■■■□□ 2.15
MBD5Q9P267 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
MBD5Q9P267 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
MBD5Q9P267 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
MBD5Q9P267 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
MBD5Q9P267 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
MBD5Q9P267 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
MBD5Q9P267 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
MBD5Q9P267 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
MBD5Q9P267 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
MBD5Q9P267 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
MBD5Q9P267 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
MBD5Q9P267 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
MBD5Q9P267 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
MBD5Q9P267 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
MBD5Q9P267 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
MBD5Q9P267 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
MBD5Q9P267 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
MBD5Q9P267 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
MBD5Q9P267 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
MBD5Q9P267 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
MBD5Q9P267 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
MBD5Q9P267 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
MBD5Q9P267 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
MBD5Q9P267 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
MBD5Q9P267 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
MBD5Q9P267 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
MBD5Q9P267 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
MBD5Q9P267 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
MBD5Q9P267 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
MBD5Q9P267 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
MBD5Q9P267 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
MBD5Q9P267 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
MBD5Q9P267 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
MBD5Q9P267 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
MBD5Q9P267 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
MBD5Q9P267 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
MBD5Q9P267 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
MBD5Q9P267 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
MBD5Q9P267 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
MBD5Q9P267 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
MBD5Q9P267 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
MBD5Q9P267 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC28.46■■■□□ 2.15
MBD5Q9P267 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
MBD5Q9P267 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
MBD5Q9P267 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
MBD5Q9P267 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
MBD5Q9P267 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
MBD5Q9P267 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
MBD5Q9P267 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
MBD5Q9P267 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
MBD5Q9P267 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
MBD5Q9P267 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
MBD5Q9P267 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
MBD5Q9P267 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
MBD5Q9P267 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
MBD5Q9P267 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
MBD5Q9P267 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
MBD5Q9P267 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC28.45■■■□□ 2.14
MBD5Q9P267 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
MBD5Q9P267 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
MBD5Q9P267 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
MBD5Q9P267 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
MBD5Q9P267 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
MBD5Q9P267 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
MBD5Q9P267 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
MBD5Q9P267 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
MBD5Q9P267 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
MBD5Q9P267 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
MBD5Q9P267 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
MBD5Q9P267 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
MBD5Q9P267 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
MBD5Q9P267 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
MBD5Q9P267 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
MBD5Q9P267 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
MBD5Q9P267 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
MBD5Q9P267 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
MBD5Q9P267 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
MBD5Q9P267 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
MBD5Q9P267 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
MBD5Q9P267 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
MBD5Q9P267 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
MBD5Q9P267 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
MBD5Q9P267 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
MBD5Q9P267 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
MBD5Q9P267 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
MBD5Q9P267 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
MBD5Q9P267 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
MBD5Q9P267 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
MBD5Q9P267 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
MBD5Q9P267 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
MBD5Q9P267 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
MBD5Q9P267 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms