Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z9

CCDC180, Coiled-coil domain-containing protein 180, humanhuman

Predictions only

Length 1,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC180Q9P1Z9 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC38.84■■■■□ 3.81
CCDC180Q9P1Z9 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
CCDC180Q9P1Z9 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
CCDC180Q9P1Z9 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
CCDC180Q9P1Z9 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC38.83■■■■□ 3.81
CCDC180Q9P1Z9 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
CCDC180Q9P1Z9 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
CCDC180Q9P1Z9 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC38.83■■■■□ 3.81
CCDC180Q9P1Z9 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC38.83■■■■□ 3.81
CCDC180Q9P1Z9 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.83■■■■□ 3.81
CCDC180Q9P1Z9 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC38.83■■■■□ 3.81
CCDC180Q9P1Z9 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.83■■■■□ 3.81
CCDC180Q9P1Z9 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC38.83■■■■□ 3.81
CCDC180Q9P1Z9 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.83■■■■□ 3.81
CCDC180Q9P1Z9 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
CCDC180Q9P1Z9 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC38.82■■■■□ 3.81
CCDC180Q9P1Z9 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC38.82■■■■□ 3.81
CCDC180Q9P1Z9 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC38.82■■■■□ 3.81
CCDC180Q9P1Z9 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.81
CCDC180Q9P1Z9 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC38.82■■■■□ 3.81
CCDC180Q9P1Z9 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.82■■■■□ 3.8
CCDC180Q9P1Z9 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.8
CCDC180Q9P1Z9 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.8
CCDC180Q9P1Z9 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
CCDC180Q9P1Z9 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
CCDC180Q9P1Z9 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.81■■■■□ 3.8
CCDC180Q9P1Z9 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
CCDC180Q9P1Z9 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
CCDC180Q9P1Z9 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
CCDC180Q9P1Z9 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
CCDC180Q9P1Z9 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
CCDC180Q9P1Z9 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
CCDC180Q9P1Z9 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
CCDC180Q9P1Z9 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC38.81■■■■□ 3.8
CCDC180Q9P1Z9 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
CCDC180Q9P1Z9 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC38.81■■■■□ 3.8
CCDC180Q9P1Z9 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC38.81■■■■□ 3.8
CCDC180Q9P1Z9 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC38.81■■■■□ 3.8
CCDC180Q9P1Z9 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
CCDC180Q9P1Z9 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC38.81■■■■□ 3.8
CCDC180Q9P1Z9 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC38.81■■■■□ 3.8
CCDC180Q9P1Z9 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
CCDC180Q9P1Z9 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.81■■■■□ 3.8
CCDC180Q9P1Z9 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
CCDC180Q9P1Z9 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
CCDC180Q9P1Z9 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.8■■■■□ 3.8
CCDC180Q9P1Z9 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
CCDC180Q9P1Z9 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC38.8■■■■□ 3.8
CCDC180Q9P1Z9 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC38.8■■■■□ 3.8
CCDC180Q9P1Z9 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
CCDC180Q9P1Z9 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC38.8■■■■□ 3.8
CCDC180Q9P1Z9 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC38.8■■■■□ 3.8
CCDC180Q9P1Z9 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC38.8■■■■□ 3.8
CCDC180Q9P1Z9 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC38.8■■■■□ 3.8
CCDC180Q9P1Z9 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.8■■■■□ 3.8
CCDC180Q9P1Z9 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.8■■■■□ 3.8
CCDC180Q9P1Z9 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC38.79■■■■□ 3.8
CCDC180Q9P1Z9 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC38.79■■■■□ 3.8
CCDC180Q9P1Z9 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
CCDC180Q9P1Z9 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
CCDC180Q9P1Z9 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC38.79■■■■□ 3.8
CCDC180Q9P1Z9 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC38.79■■■■□ 3.8
CCDC180Q9P1Z9 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC38.79■■■■□ 3.8
CCDC180Q9P1Z9 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
CCDC180Q9P1Z9 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC38.79■■■■□ 3.8
CCDC180Q9P1Z9 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
CCDC180Q9P1Z9 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
CCDC180Q9P1Z9 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
CCDC180Q9P1Z9 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC38.78■■■■□ 3.8
CCDC180Q9P1Z9 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC38.78■■■■□ 3.8
CCDC180Q9P1Z9 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC38.78■■■■□ 3.8
CCDC180Q9P1Z9 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
CCDC180Q9P1Z9 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
CCDC180Q9P1Z9 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC38.78■■■■□ 3.8
CCDC180Q9P1Z9 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC38.78■■■■□ 3.8
CCDC180Q9P1Z9 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
CCDC180Q9P1Z9 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
CCDC180Q9P1Z9 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC38.78■■■■□ 3.8
CCDC180Q9P1Z9 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC38.78■■■■□ 3.8
CCDC180Q9P1Z9 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
CCDC180Q9P1Z9 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC38.78■■■■□ 3.8
CCDC180Q9P1Z9 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC38.78■■■■□ 3.8
CCDC180Q9P1Z9 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC38.78■■■■□ 3.8
CCDC180Q9P1Z9 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
CCDC180Q9P1Z9 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC38.78■■■■□ 3.8
CCDC180Q9P1Z9 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
CCDC180Q9P1Z9 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
CCDC180Q9P1Z9 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
CCDC180Q9P1Z9 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC38.77■■■■□ 3.8
CCDC180Q9P1Z9 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC38.77■■■■□ 3.8
CCDC180Q9P1Z9 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
CCDC180Q9P1Z9 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
CCDC180Q9P1Z9 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.77■■■■□ 3.8
CCDC180Q9P1Z9 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC38.77■■■■□ 3.8
CCDC180Q9P1Z9 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC38.77■■■■□ 3.8
CCDC180Q9P1Z9 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
CCDC180Q9P1Z9 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC38.77■■■■□ 3.8
CCDC180Q9P1Z9 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC38.77■■■■□ 3.8
CCDC180Q9P1Z9 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
CCDC180Q9P1Z9 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms