Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1F3

ABRACL, Costars family protein ABRACL, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABRACLQ9P1F3 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ABRACLQ9P1F3 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ABRACLQ9P1F3 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ABRACLQ9P1F3 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ABRACLQ9P1F3 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ABRACLQ9P1F3 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ABRACLQ9P1F3 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ABRACLQ9P1F3 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ABRACLQ9P1F3 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ABRACLQ9P1F3 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ABRACLQ9P1F3 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ABRACLQ9P1F3 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ABRACLQ9P1F3 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ABRACLQ9P1F3 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ABRACLQ9P1F3 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ABRACLQ9P1F3 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ABRACLQ9P1F3 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ABRACLQ9P1F3 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ABRACLQ9P1F3 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ABRACLQ9P1F3 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ABRACLQ9P1F3 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ABRACLQ9P1F3 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ABRACLQ9P1F3 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ABRACLQ9P1F3 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ABRACLQ9P1F3 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ABRACLQ9P1F3 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ABRACLQ9P1F3 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ABRACLQ9P1F3 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ABRACLQ9P1F3 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ABRACLQ9P1F3 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ABRACLQ9P1F3 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ABRACLQ9P1F3 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ABRACLQ9P1F3 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ABRACLQ9P1F3 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ABRACLQ9P1F3 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ABRACLQ9P1F3 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ABRACLQ9P1F3 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ABRACLQ9P1F3 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ABRACLQ9P1F3 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ABRACLQ9P1F3 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ABRACLQ9P1F3 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ABRACLQ9P1F3 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ABRACLQ9P1F3 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ABRACLQ9P1F3 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ABRACLQ9P1F3 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ABRACLQ9P1F3 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ABRACLQ9P1F3 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ABRACLQ9P1F3 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ABRACLQ9P1F3 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ABRACLQ9P1F3 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ABRACLQ9P1F3 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ABRACLQ9P1F3 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ABRACLQ9P1F3 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ABRACLQ9P1F3 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ABRACLQ9P1F3 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ABRACLQ9P1F3 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ABRACLQ9P1F3 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ABRACLQ9P1F3 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ABRACLQ9P1F3 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ABRACLQ9P1F3 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ABRACLQ9P1F3 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ABRACLQ9P1F3 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ABRACLQ9P1F3 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ABRACLQ9P1F3 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ABRACLQ9P1F3 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ABRACLQ9P1F3 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ABRACLQ9P1F3 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ABRACLQ9P1F3 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ABRACLQ9P1F3 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ABRACLQ9P1F3 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ABRACLQ9P1F3 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ABRACLQ9P1F3 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ABRACLQ9P1F3 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ABRACLQ9P1F3 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ABRACLQ9P1F3 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ABRACLQ9P1F3 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ABRACLQ9P1F3 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ABRACLQ9P1F3 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ABRACLQ9P1F3 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ABRACLQ9P1F3 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ABRACLQ9P1F3 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ABRACLQ9P1F3 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ABRACLQ9P1F3 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ABRACLQ9P1F3 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ABRACLQ9P1F3 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ABRACLQ9P1F3 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ABRACLQ9P1F3 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ABRACLQ9P1F3 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ABRACLQ9P1F3 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ABRACLQ9P1F3 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ABRACLQ9P1F3 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ABRACLQ9P1F3 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ABRACLQ9P1F3 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ABRACLQ9P1F3 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ABRACLQ9P1F3 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ABRACLQ9P1F3 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ABRACLQ9P1F3 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ABRACLQ9P1F3 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ABRACLQ9P1F3 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ABRACLQ9P1F3 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms