Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZU7

CABP1, Calcium-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABP1Q9NZU7 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CABP1Q9NZU7 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CABP1Q9NZU7 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CABP1Q9NZU7 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CABP1Q9NZU7 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CABP1Q9NZU7 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CABP1Q9NZU7 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CABP1Q9NZU7 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CABP1Q9NZU7 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CABP1Q9NZU7 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CABP1Q9NZU7 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CABP1Q9NZU7 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CABP1Q9NZU7 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
CABP1Q9NZU7 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CABP1Q9NZU7 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CABP1Q9NZU7 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CABP1Q9NZU7 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CABP1Q9NZU7 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CABP1Q9NZU7 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CABP1Q9NZU7 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CABP1Q9NZU7 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CABP1Q9NZU7 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CABP1Q9NZU7 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CABP1Q9NZU7 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CABP1Q9NZU7 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CABP1Q9NZU7 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CABP1Q9NZU7 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CABP1Q9NZU7 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CABP1Q9NZU7 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CABP1Q9NZU7 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CABP1Q9NZU7 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CABP1Q9NZU7 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CABP1Q9NZU7 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CABP1Q9NZU7 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CABP1Q9NZU7 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CABP1Q9NZU7 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
CABP1Q9NZU7 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CABP1Q9NZU7 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CABP1Q9NZU7 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CABP1Q9NZU7 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CABP1Q9NZU7 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CABP1Q9NZU7 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CABP1Q9NZU7 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
CABP1Q9NZU7 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CABP1Q9NZU7 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CABP1Q9NZU7 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CABP1Q9NZU7 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CABP1Q9NZU7 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CABP1Q9NZU7 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CABP1Q9NZU7 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CABP1Q9NZU7 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CABP1Q9NZU7 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CABP1Q9NZU7 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CABP1Q9NZU7 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CABP1Q9NZU7 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CABP1Q9NZU7 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CABP1Q9NZU7 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CABP1Q9NZU7 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CABP1Q9NZU7 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CABP1Q9NZU7 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CABP1Q9NZU7 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CABP1Q9NZU7 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CABP1Q9NZU7 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
CABP1Q9NZU7 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CABP1Q9NZU7 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CABP1Q9NZU7 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CABP1Q9NZU7 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CABP1Q9NZU7 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CABP1Q9NZU7 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CABP1Q9NZU7 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CABP1Q9NZU7 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CABP1Q9NZU7 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CABP1Q9NZU7 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CABP1Q9NZU7 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CABP1Q9NZU7 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CABP1Q9NZU7 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CABP1Q9NZU7 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CABP1Q9NZU7 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CABP1Q9NZU7 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CABP1Q9NZU7 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CABP1Q9NZU7 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CABP1Q9NZU7 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CABP1Q9NZU7 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CABP1Q9NZU7 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CABP1Q9NZU7 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CABP1Q9NZU7 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
CABP1Q9NZU7 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CABP1Q9NZU7 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CABP1Q9NZU7 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CABP1Q9NZU7 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
CABP1Q9NZU7 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
CABP1Q9NZU7 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CABP1Q9NZU7 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CABP1Q9NZU7 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CABP1Q9NZU7 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CABP1Q9NZU7 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CABP1Q9NZU7 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CABP1Q9NZU7 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
CABP1Q9NZU7 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CABP1Q9NZU7 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms