Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC3

GDE1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1Q9NZC3 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GDE1Q9NZC3 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GDE1Q9NZC3 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GDE1Q9NZC3 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GDE1Q9NZC3 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GDE1Q9NZC3 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GDE1Q9NZC3 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GDE1Q9NZC3 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
GDE1Q9NZC3 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
GDE1Q9NZC3 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GDE1Q9NZC3 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GDE1Q9NZC3 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GDE1Q9NZC3 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GDE1Q9NZC3 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GDE1Q9NZC3 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GDE1Q9NZC3 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GDE1Q9NZC3 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GDE1Q9NZC3 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GDE1Q9NZC3 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
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GDE1Q9NZC3 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GDE1Q9NZC3 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
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GDE1Q9NZC3 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GDE1Q9NZC3 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GDE1Q9NZC3 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
GDE1Q9NZC3 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GDE1Q9NZC3 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GDE1Q9NZC3 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GDE1Q9NZC3 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GDE1Q9NZC3 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GDE1Q9NZC3 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GDE1Q9NZC3 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GDE1Q9NZC3 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GDE1Q9NZC3 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GDE1Q9NZC3 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
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GDE1Q9NZC3 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GDE1Q9NZC3 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
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GDE1Q9NZC3 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GDE1Q9NZC3 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GDE1Q9NZC3 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GDE1Q9NZC3 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GDE1Q9NZC3 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GDE1Q9NZC3 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GDE1Q9NZC3 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
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GDE1Q9NZC3 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GDE1Q9NZC3 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
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GDE1Q9NZC3 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GDE1Q9NZC3 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GDE1Q9NZC3 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
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GDE1Q9NZC3 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GDE1Q9NZC3 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GDE1Q9NZC3 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GDE1Q9NZC3 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
GDE1Q9NZC3 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GDE1Q9NZC3 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GDE1Q9NZC3 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GDE1Q9NZC3 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GDE1Q9NZC3 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GDE1Q9NZC3 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GDE1Q9NZC3 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GDE1Q9NZC3 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GDE1Q9NZC3 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
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