Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXJ0

MS4A12, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 12, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A12Q9NXJ0 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MS4A12Q9NXJ0 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MS4A12Q9NXJ0 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MS4A12Q9NXJ0 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MS4A12Q9NXJ0 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MS4A12Q9NXJ0 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MS4A12Q9NXJ0 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MS4A12Q9NXJ0 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MS4A12Q9NXJ0 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MS4A12Q9NXJ0 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MS4A12Q9NXJ0 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MS4A12Q9NXJ0 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MS4A12Q9NXJ0 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MS4A12Q9NXJ0 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MS4A12Q9NXJ0 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
MS4A12Q9NXJ0 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MS4A12Q9NXJ0 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MS4A12Q9NXJ0 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MS4A12Q9NXJ0 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MS4A12Q9NXJ0 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MS4A12Q9NXJ0 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MS4A12Q9NXJ0 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MS4A12Q9NXJ0 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MS4A12Q9NXJ0 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MS4A12Q9NXJ0 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MS4A12Q9NXJ0 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MS4A12Q9NXJ0 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MS4A12Q9NXJ0 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MS4A12Q9NXJ0 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MS4A12Q9NXJ0 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MS4A12Q9NXJ0 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MS4A12Q9NXJ0 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MS4A12Q9NXJ0 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MS4A12Q9NXJ0 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MS4A12Q9NXJ0 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MS4A12Q9NXJ0 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MS4A12Q9NXJ0 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MS4A12Q9NXJ0 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MS4A12Q9NXJ0 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MS4A12Q9NXJ0 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MS4A12Q9NXJ0 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
MS4A12Q9NXJ0 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MS4A12Q9NXJ0 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MS4A12Q9NXJ0 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MS4A12Q9NXJ0 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MS4A12Q9NXJ0 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MS4A12Q9NXJ0 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MS4A12Q9NXJ0 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MS4A12Q9NXJ0 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MS4A12Q9NXJ0 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MS4A12Q9NXJ0 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MS4A12Q9NXJ0 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MS4A12Q9NXJ0 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MS4A12Q9NXJ0 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
MS4A12Q9NXJ0 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
MS4A12Q9NXJ0 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MS4A12Q9NXJ0 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MS4A12Q9NXJ0 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MS4A12Q9NXJ0 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MS4A12Q9NXJ0 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MS4A12Q9NXJ0 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MS4A12Q9NXJ0 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MS4A12Q9NXJ0 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MS4A12Q9NXJ0 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MS4A12Q9NXJ0 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MS4A12Q9NXJ0 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MS4A12Q9NXJ0 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MS4A12Q9NXJ0 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MS4A12Q9NXJ0 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MS4A12Q9NXJ0 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MS4A12Q9NXJ0 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MS4A12Q9NXJ0 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MS4A12Q9NXJ0 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MS4A12Q9NXJ0 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MS4A12Q9NXJ0 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MS4A12Q9NXJ0 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MS4A12Q9NXJ0 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
MS4A12Q9NXJ0 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
MS4A12Q9NXJ0 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MS4A12Q9NXJ0 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MS4A12Q9NXJ0 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MS4A12Q9NXJ0 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
MS4A12Q9NXJ0 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MS4A12Q9NXJ0 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MS4A12Q9NXJ0 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MS4A12Q9NXJ0 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MS4A12Q9NXJ0 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MS4A12Q9NXJ0 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MS4A12Q9NXJ0 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MS4A12Q9NXJ0 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
MS4A12Q9NXJ0 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
MS4A12Q9NXJ0 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
MS4A12Q9NXJ0 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
MS4A12Q9NXJ0 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
MS4A12Q9NXJ0 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
MS4A12Q9NXJ0 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
MS4A12Q9NXJ0 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
MS4A12Q9NXJ0 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
MS4A12Q9NXJ0 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
MS4A12Q9NXJ0 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms