Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXH8

TOR4A, Torsin-4A, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOR4AQ9NXH8 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TOR4AQ9NXH8 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TOR4AQ9NXH8 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TOR4AQ9NXH8 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TOR4AQ9NXH8 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TOR4AQ9NXH8 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TOR4AQ9NXH8 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TOR4AQ9NXH8 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TOR4AQ9NXH8 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TOR4AQ9NXH8 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TOR4AQ9NXH8 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TOR4AQ9NXH8 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
TOR4AQ9NXH8 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TOR4AQ9NXH8 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TOR4AQ9NXH8 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TOR4AQ9NXH8 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TOR4AQ9NXH8 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TOR4AQ9NXH8 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TOR4AQ9NXH8 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TOR4AQ9NXH8 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TOR4AQ9NXH8 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TOR4AQ9NXH8 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TOR4AQ9NXH8 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TOR4AQ9NXH8 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TOR4AQ9NXH8 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TOR4AQ9NXH8 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TOR4AQ9NXH8 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TOR4AQ9NXH8 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TOR4AQ9NXH8 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TOR4AQ9NXH8 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TOR4AQ9NXH8 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TOR4AQ9NXH8 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TOR4AQ9NXH8 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TOR4AQ9NXH8 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TOR4AQ9NXH8 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TOR4AQ9NXH8 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
TOR4AQ9NXH8 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TOR4AQ9NXH8 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TOR4AQ9NXH8 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TOR4AQ9NXH8 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TOR4AQ9NXH8 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TOR4AQ9NXH8 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
TOR4AQ9NXH8 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TOR4AQ9NXH8 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TOR4AQ9NXH8 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TOR4AQ9NXH8 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TOR4AQ9NXH8 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TOR4AQ9NXH8 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TOR4AQ9NXH8 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TOR4AQ9NXH8 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TOR4AQ9NXH8 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TOR4AQ9NXH8 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TOR4AQ9NXH8 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TOR4AQ9NXH8 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TOR4AQ9NXH8 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
TOR4AQ9NXH8 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TOR4AQ9NXH8 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TOR4AQ9NXH8 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TOR4AQ9NXH8 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TOR4AQ9NXH8 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TOR4AQ9NXH8 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TOR4AQ9NXH8 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TOR4AQ9NXH8 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TOR4AQ9NXH8 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TOR4AQ9NXH8 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TOR4AQ9NXH8 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TOR4AQ9NXH8 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TOR4AQ9NXH8 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TOR4AQ9NXH8 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TOR4AQ9NXH8 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TOR4AQ9NXH8 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TOR4AQ9NXH8 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TOR4AQ9NXH8 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TOR4AQ9NXH8 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TOR4AQ9NXH8 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TOR4AQ9NXH8 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TOR4AQ9NXH8 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TOR4AQ9NXH8 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TOR4AQ9NXH8 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TOR4AQ9NXH8 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TOR4AQ9NXH8 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TOR4AQ9NXH8 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TOR4AQ9NXH8 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TOR4AQ9NXH8 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TOR4AQ9NXH8 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TOR4AQ9NXH8 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TOR4AQ9NXH8 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TOR4AQ9NXH8 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TOR4AQ9NXH8 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TOR4AQ9NXH8 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TOR4AQ9NXH8 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TOR4AQ9NXH8 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TOR4AQ9NXH8 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
TOR4AQ9NXH8 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TOR4AQ9NXH8 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
TOR4AQ9NXH8 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
TOR4AQ9NXH8 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
TOR4AQ9NXH8 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TOR4AQ9NXH8 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
TOR4AQ9NXH8 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms