Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW68

BSDC1, BSD domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BSDC1Q9NW68 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BSDC1Q9NW68 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BSDC1Q9NW68 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BSDC1Q9NW68 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BSDC1Q9NW68 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BSDC1Q9NW68 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BSDC1Q9NW68 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BSDC1Q9NW68 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
BSDC1Q9NW68 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
BSDC1Q9NW68 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BSDC1Q9NW68 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BSDC1Q9NW68 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
BSDC1Q9NW68 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BSDC1Q9NW68 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BSDC1Q9NW68 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BSDC1Q9NW68 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BSDC1Q9NW68 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BSDC1Q9NW68 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BSDC1Q9NW68 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BSDC1Q9NW68 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BSDC1Q9NW68 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BSDC1Q9NW68 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BSDC1Q9NW68 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BSDC1Q9NW68 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BSDC1Q9NW68 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BSDC1Q9NW68 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BSDC1Q9NW68 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BSDC1Q9NW68 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BSDC1Q9NW68 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BSDC1Q9NW68 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BSDC1Q9NW68 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BSDC1Q9NW68 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BSDC1Q9NW68 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
BSDC1Q9NW68 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BSDC1Q9NW68 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BSDC1Q9NW68 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BSDC1Q9NW68 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BSDC1Q9NW68 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BSDC1Q9NW68 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BSDC1Q9NW68 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BSDC1Q9NW68 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BSDC1Q9NW68 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BSDC1Q9NW68 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
BSDC1Q9NW68 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BSDC1Q9NW68 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BSDC1Q9NW68 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BSDC1Q9NW68 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BSDC1Q9NW68 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BSDC1Q9NW68 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BSDC1Q9NW68 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
BSDC1Q9NW68 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
BSDC1Q9NW68 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
BSDC1Q9NW68 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BSDC1Q9NW68 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BSDC1Q9NW68 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
BSDC1Q9NW68 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BSDC1Q9NW68 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BSDC1Q9NW68 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BSDC1Q9NW68 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BSDC1Q9NW68 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BSDC1Q9NW68 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BSDC1Q9NW68 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BSDC1Q9NW68 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
BSDC1Q9NW68 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BSDC1Q9NW68 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BSDC1Q9NW68 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BSDC1Q9NW68 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BSDC1Q9NW68 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BSDC1Q9NW68 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BSDC1Q9NW68 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BSDC1Q9NW68 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BSDC1Q9NW68 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BSDC1Q9NW68 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BSDC1Q9NW68 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BSDC1Q9NW68 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BSDC1Q9NW68 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BSDC1Q9NW68 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BSDC1Q9NW68 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BSDC1Q9NW68 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BSDC1Q9NW68 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BSDC1Q9NW68 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BSDC1Q9NW68 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BSDC1Q9NW68 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BSDC1Q9NW68 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BSDC1Q9NW68 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BSDC1Q9NW68 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BSDC1Q9NW68 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BSDC1Q9NW68 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BSDC1Q9NW68 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BSDC1Q9NW68 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BSDC1Q9NW68 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BSDC1Q9NW68 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BSDC1Q9NW68 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BSDC1Q9NW68 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BSDC1Q9NW68 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BSDC1Q9NW68 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BSDC1Q9NW68 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BSDC1Q9NW68 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BSDC1Q9NW68 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BSDC1Q9NW68 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms