Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVM6

DNAJC17, DnaJ homolog subfamily C member 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC17Q9NVM6 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DNAJC17Q9NVM6 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DNAJC17Q9NVM6 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DNAJC17Q9NVM6 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DNAJC17Q9NVM6 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DNAJC17Q9NVM6 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DNAJC17Q9NVM6 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DNAJC17Q9NVM6 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DNAJC17Q9NVM6 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DNAJC17Q9NVM6 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
DNAJC17Q9NVM6 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DNAJC17Q9NVM6 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DNAJC17Q9NVM6 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DNAJC17Q9NVM6 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DNAJC17Q9NVM6 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DNAJC17Q9NVM6 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DNAJC17Q9NVM6 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DNAJC17Q9NVM6 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DNAJC17Q9NVM6 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DNAJC17Q9NVM6 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DNAJC17Q9NVM6 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DNAJC17Q9NVM6 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DNAJC17Q9NVM6 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DNAJC17Q9NVM6 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DNAJC17Q9NVM6 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DNAJC17Q9NVM6 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DNAJC17Q9NVM6 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DNAJC17Q9NVM6 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DNAJC17Q9NVM6 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DNAJC17Q9NVM6 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DNAJC17Q9NVM6 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
DNAJC17Q9NVM6 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DNAJC17Q9NVM6 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DNAJC17Q9NVM6 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DNAJC17Q9NVM6 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DNAJC17Q9NVM6 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DNAJC17Q9NVM6 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DNAJC17Q9NVM6 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
DNAJC17Q9NVM6 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DNAJC17Q9NVM6 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
DNAJC17Q9NVM6 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DNAJC17Q9NVM6 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DNAJC17Q9NVM6 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DNAJC17Q9NVM6 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DNAJC17Q9NVM6 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DNAJC17Q9NVM6 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DNAJC17Q9NVM6 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
DNAJC17Q9NVM6 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DNAJC17Q9NVM6 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DNAJC17Q9NVM6 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DNAJC17Q9NVM6 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DNAJC17Q9NVM6 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DNAJC17Q9NVM6 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DNAJC17Q9NVM6 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DNAJC17Q9NVM6 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DNAJC17Q9NVM6 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DNAJC17Q9NVM6 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DNAJC17Q9NVM6 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DNAJC17Q9NVM6 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DNAJC17Q9NVM6 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DNAJC17Q9NVM6 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DNAJC17Q9NVM6 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DNAJC17Q9NVM6 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DNAJC17Q9NVM6 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DNAJC17Q9NVM6 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DNAJC17Q9NVM6 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DNAJC17Q9NVM6 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DNAJC17Q9NVM6 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DNAJC17Q9NVM6 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DNAJC17Q9NVM6 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DNAJC17Q9NVM6 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DNAJC17Q9NVM6 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DNAJC17Q9NVM6 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DNAJC17Q9NVM6 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DNAJC17Q9NVM6 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DNAJC17Q9NVM6 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DNAJC17Q9NVM6 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DNAJC17Q9NVM6 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DNAJC17Q9NVM6 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DNAJC17Q9NVM6 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DNAJC17Q9NVM6 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DNAJC17Q9NVM6 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DNAJC17Q9NVM6 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DNAJC17Q9NVM6 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DNAJC17Q9NVM6 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DNAJC17Q9NVM6 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DNAJC17Q9NVM6 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DNAJC17Q9NVM6 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DNAJC17Q9NVM6 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DNAJC17Q9NVM6 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DNAJC17Q9NVM6 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DNAJC17Q9NVM6 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DNAJC17Q9NVM6 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DNAJC17Q9NVM6 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DNAJC17Q9NVM6 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DNAJC17Q9NVM6 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DNAJC17Q9NVM6 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DNAJC17Q9NVM6 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
DNAJC17Q9NVM6 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DNAJC17Q9NVM6 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms