Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT22

EMILIN3, EMILIN-3, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMILIN3Q9NT22 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EMILIN3Q9NT22 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EMILIN3Q9NT22 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EMILIN3Q9NT22 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
EMILIN3Q9NT22 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EMILIN3Q9NT22 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EMILIN3Q9NT22 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EMILIN3Q9NT22 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EMILIN3Q9NT22 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EMILIN3Q9NT22 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EMILIN3Q9NT22 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EMILIN3Q9NT22 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EMILIN3Q9NT22 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EMILIN3Q9NT22 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
EMILIN3Q9NT22 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EMILIN3Q9NT22 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EMILIN3Q9NT22 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EMILIN3Q9NT22 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EMILIN3Q9NT22 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EMILIN3Q9NT22 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EMILIN3Q9NT22 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EMILIN3Q9NT22 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EMILIN3Q9NT22 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EMILIN3Q9NT22 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EMILIN3Q9NT22 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EMILIN3Q9NT22 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EMILIN3Q9NT22 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EMILIN3Q9NT22 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EMILIN3Q9NT22 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EMILIN3Q9NT22 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EMILIN3Q9NT22 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EMILIN3Q9NT22 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EMILIN3Q9NT22 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EMILIN3Q9NT22 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EMILIN3Q9NT22 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EMILIN3Q9NT22 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EMILIN3Q9NT22 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EMILIN3Q9NT22 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
EMILIN3Q9NT22 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EMILIN3Q9NT22 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EMILIN3Q9NT22 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EMILIN3Q9NT22 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EMILIN3Q9NT22 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EMILIN3Q9NT22 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EMILIN3Q9NT22 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EMILIN3Q9NT22 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EMILIN3Q9NT22 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EMILIN3Q9NT22 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EMILIN3Q9NT22 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EMILIN3Q9NT22 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EMILIN3Q9NT22 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EMILIN3Q9NT22 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EMILIN3Q9NT22 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EMILIN3Q9NT22 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EMILIN3Q9NT22 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
EMILIN3Q9NT22 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
EMILIN3Q9NT22 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
EMILIN3Q9NT22 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
EMILIN3Q9NT22 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EMILIN3Q9NT22 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EMILIN3Q9NT22 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EMILIN3Q9NT22 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
EMILIN3Q9NT22 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EMILIN3Q9NT22 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EMILIN3Q9NT22 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EMILIN3Q9NT22 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EMILIN3Q9NT22 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EMILIN3Q9NT22 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EMILIN3Q9NT22 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
EMILIN3Q9NT22 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EMILIN3Q9NT22 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EMILIN3Q9NT22 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EMILIN3Q9NT22 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EMILIN3Q9NT22 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EMILIN3Q9NT22 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EMILIN3Q9NT22 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EMILIN3Q9NT22 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EMILIN3Q9NT22 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
EMILIN3Q9NT22 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EMILIN3Q9NT22 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EMILIN3Q9NT22 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EMILIN3Q9NT22 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EMILIN3Q9NT22 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EMILIN3Q9NT22 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EMILIN3Q9NT22 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EMILIN3Q9NT22 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EMILIN3Q9NT22 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EMILIN3Q9NT22 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EMILIN3Q9NT22 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EMILIN3Q9NT22 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EMILIN3Q9NT22 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EMILIN3Q9NT22 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EMILIN3Q9NT22 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EMILIN3Q9NT22 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
EMILIN3Q9NT22 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EMILIN3Q9NT22 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EMILIN3Q9NT22 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EMILIN3Q9NT22 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
EMILIN3Q9NT22 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EMILIN3Q9NT22 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms