Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC2

SALL1, Sal-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL1Q9NSC2 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SALL1Q9NSC2 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SALL1Q9NSC2 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SALL1Q9NSC2 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SALL1Q9NSC2 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SALL1Q9NSC2 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SALL1Q9NSC2 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SALL1Q9NSC2 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SALL1Q9NSC2 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SALL1Q9NSC2 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SALL1Q9NSC2 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SALL1Q9NSC2 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SALL1Q9NSC2 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SALL1Q9NSC2 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SALL1Q9NSC2 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SALL1Q9NSC2 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SALL1Q9NSC2 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SALL1Q9NSC2 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SALL1Q9NSC2 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SALL1Q9NSC2 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SALL1Q9NSC2 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SALL1Q9NSC2 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SALL1Q9NSC2 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SALL1Q9NSC2 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SALL1Q9NSC2 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SALL1Q9NSC2 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SALL1Q9NSC2 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SALL1Q9NSC2 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SALL1Q9NSC2 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SALL1Q9NSC2 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SALL1Q9NSC2 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SALL1Q9NSC2 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SALL1Q9NSC2 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SALL1Q9NSC2 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SALL1Q9NSC2 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SALL1Q9NSC2 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SALL1Q9NSC2 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SALL1Q9NSC2 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SALL1Q9NSC2 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SALL1Q9NSC2 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SALL1Q9NSC2 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SALL1Q9NSC2 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SALL1Q9NSC2 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SALL1Q9NSC2 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SALL1Q9NSC2 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SALL1Q9NSC2 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SALL1Q9NSC2 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SALL1Q9NSC2 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SALL1Q9NSC2 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SALL1Q9NSC2 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SALL1Q9NSC2 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SALL1Q9NSC2 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SALL1Q9NSC2 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
SALL1Q9NSC2 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SALL1Q9NSC2 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
SALL1Q9NSC2 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SALL1Q9NSC2 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SALL1Q9NSC2 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SALL1Q9NSC2 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
SALL1Q9NSC2 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SALL1Q9NSC2 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SALL1Q9NSC2 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
SALL1Q9NSC2 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SALL1Q9NSC2 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SALL1Q9NSC2 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SALL1Q9NSC2 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SALL1Q9NSC2 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SALL1Q9NSC2 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SALL1Q9NSC2 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SALL1Q9NSC2 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SALL1Q9NSC2 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SALL1Q9NSC2 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SALL1Q9NSC2 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SALL1Q9NSC2 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SALL1Q9NSC2 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SALL1Q9NSC2 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SALL1Q9NSC2 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SALL1Q9NSC2 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SALL1Q9NSC2 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SALL1Q9NSC2 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SALL1Q9NSC2 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SALL1Q9NSC2 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SALL1Q9NSC2 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SALL1Q9NSC2 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SALL1Q9NSC2 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SALL1Q9NSC2 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SALL1Q9NSC2 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SALL1Q9NSC2 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SALL1Q9NSC2 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SALL1Q9NSC2 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SALL1Q9NSC2 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SALL1Q9NSC2 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SALL1Q9NSC2 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SALL1Q9NSC2 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SALL1Q9NSC2 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SALL1Q9NSC2 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SALL1Q9NSC2 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SALL1Q9NSC2 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SALL1Q9NSC2 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SALL1Q9NSC2 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms