Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRR3

CDC42SE2, CDC42 small effector protein 2, humanhuman

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Length 84 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42SE2Q9NRR3 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CDC42SE2Q9NRR3 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CDC42SE2Q9NRR3 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CDC42SE2Q9NRR3 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CDC42SE2Q9NRR3 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CDC42SE2Q9NRR3 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CDC42SE2Q9NRR3 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CDC42SE2Q9NRR3 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CDC42SE2Q9NRR3 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CDC42SE2Q9NRR3 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CDC42SE2Q9NRR3 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CDC42SE2Q9NRR3 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
CDC42SE2Q9NRR3 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CDC42SE2Q9NRR3 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CDC42SE2Q9NRR3 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CDC42SE2Q9NRR3 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CDC42SE2Q9NRR3 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
CDC42SE2Q9NRR3 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CDC42SE2Q9NRR3 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CDC42SE2Q9NRR3 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CDC42SE2Q9NRR3 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CDC42SE2Q9NRR3 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CDC42SE2Q9NRR3 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CDC42SE2Q9NRR3 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CDC42SE2Q9NRR3 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CDC42SE2Q9NRR3 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CDC42SE2Q9NRR3 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CDC42SE2Q9NRR3 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CDC42SE2Q9NRR3 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CDC42SE2Q9NRR3 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CDC42SE2Q9NRR3 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CDC42SE2Q9NRR3 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CDC42SE2Q9NRR3 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CDC42SE2Q9NRR3 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CDC42SE2Q9NRR3 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CDC42SE2Q9NRR3 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CDC42SE2Q9NRR3 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CDC42SE2Q9NRR3 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CDC42SE2Q9NRR3 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CDC42SE2Q9NRR3 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CDC42SE2Q9NRR3 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CDC42SE2Q9NRR3 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CDC42SE2Q9NRR3 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CDC42SE2Q9NRR3 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CDC42SE2Q9NRR3 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CDC42SE2Q9NRR3 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CDC42SE2Q9NRR3 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CDC42SE2Q9NRR3 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CDC42SE2Q9NRR3 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CDC42SE2Q9NRR3 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CDC42SE2Q9NRR3 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CDC42SE2Q9NRR3 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CDC42SE2Q9NRR3 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
CDC42SE2Q9NRR3 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CDC42SE2Q9NRR3 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
CDC42SE2Q9NRR3 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CDC42SE2Q9NRR3 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CDC42SE2Q9NRR3 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CDC42SE2Q9NRR3 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CDC42SE2Q9NRR3 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CDC42SE2Q9NRR3 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CDC42SE2Q9NRR3 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CDC42SE2Q9NRR3 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CDC42SE2Q9NRR3 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CDC42SE2Q9NRR3 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CDC42SE2Q9NRR3 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CDC42SE2Q9NRR3 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CDC42SE2Q9NRR3 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CDC42SE2Q9NRR3 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
CDC42SE2Q9NRR3 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CDC42SE2Q9NRR3 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CDC42SE2Q9NRR3 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CDC42SE2Q9NRR3 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CDC42SE2Q9NRR3 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CDC42SE2Q9NRR3 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CDC42SE2Q9NRR3 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CDC42SE2Q9NRR3 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CDC42SE2Q9NRR3 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CDC42SE2Q9NRR3 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CDC42SE2Q9NRR3 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
CDC42SE2Q9NRR3 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
CDC42SE2Q9NRR3 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
CDC42SE2Q9NRR3 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
CDC42SE2Q9NRR3 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CDC42SE2Q9NRR3 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CDC42SE2Q9NRR3 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CDC42SE2Q9NRR3 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CDC42SE2Q9NRR3 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CDC42SE2Q9NRR3 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CDC42SE2Q9NRR3 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CDC42SE2Q9NRR3 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CDC42SE2Q9NRR3 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CDC42SE2Q9NRR3 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CDC42SE2Q9NRR3 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CDC42SE2Q9NRR3 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
CDC42SE2Q9NRR3 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CDC42SE2Q9NRR3 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CDC42SE2Q9NRR3 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CDC42SE2Q9NRR3 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
CDC42SE2Q9NRR3 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
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