Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRB3

CHST12, Carbohydrate sulfotransferase 12, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST12Q9NRB3 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHST12Q9NRB3 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHST12Q9NRB3 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHST12Q9NRB3 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHST12Q9NRB3 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHST12Q9NRB3 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHST12Q9NRB3 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHST12Q9NRB3 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHST12Q9NRB3 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHST12Q9NRB3 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHST12Q9NRB3 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHST12Q9NRB3 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHST12Q9NRB3 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHST12Q9NRB3 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHST12Q9NRB3 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHST12Q9NRB3 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHST12Q9NRB3 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHST12Q9NRB3 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CHST12Q9NRB3 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHST12Q9NRB3 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CHST12Q9NRB3 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHST12Q9NRB3 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHST12Q9NRB3 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHST12Q9NRB3 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHST12Q9NRB3 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHST12Q9NRB3 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHST12Q9NRB3 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHST12Q9NRB3 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHST12Q9NRB3 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHST12Q9NRB3 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHST12Q9NRB3 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHST12Q9NRB3 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHST12Q9NRB3 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHST12Q9NRB3 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHST12Q9NRB3 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CHST12Q9NRB3 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHST12Q9NRB3 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHST12Q9NRB3 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CHST12Q9NRB3 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CHST12Q9NRB3 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CHST12Q9NRB3 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CHST12Q9NRB3 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CHST12Q9NRB3 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CHST12Q9NRB3 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CHST12Q9NRB3 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CHST12Q9NRB3 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CHST12Q9NRB3 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CHST12Q9NRB3 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CHST12Q9NRB3 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CHST12Q9NRB3 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CHST12Q9NRB3 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CHST12Q9NRB3 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CHST12Q9NRB3 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CHST12Q9NRB3 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CHST12Q9NRB3 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CHST12Q9NRB3 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CHST12Q9NRB3 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CHST12Q9NRB3 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CHST12Q9NRB3 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CHST12Q9NRB3 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CHST12Q9NRB3 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CHST12Q9NRB3 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CHST12Q9NRB3 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CHST12Q9NRB3 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CHST12Q9NRB3 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CHST12Q9NRB3 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CHST12Q9NRB3 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CHST12Q9NRB3 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CHST12Q9NRB3 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CHST12Q9NRB3 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CHST12Q9NRB3 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CHST12Q9NRB3 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CHST12Q9NRB3 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CHST12Q9NRB3 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CHST12Q9NRB3 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CHST12Q9NRB3 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CHST12Q9NRB3 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CHST12Q9NRB3 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CHST12Q9NRB3 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CHST12Q9NRB3 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CHST12Q9NRB3 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CHST12Q9NRB3 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CHST12Q9NRB3 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CHST12Q9NRB3 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
CHST12Q9NRB3 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
CHST12Q9NRB3 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CHST12Q9NRB3 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CHST12Q9NRB3 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
CHST12Q9NRB3 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CHST12Q9NRB3 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CHST12Q9NRB3 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CHST12Q9NRB3 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
CHST12Q9NRB3 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CHST12Q9NRB3 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CHST12Q9NRB3 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CHST12Q9NRB3 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CHST12Q9NRB3 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CHST12Q9NRB3 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CHST12Q9NRB3 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CHST12Q9NRB3 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms