Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR55

BATF3, Basic leucine zipper transcriptional factor ATF-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BATF3Q9NR55 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BATF3Q9NR55 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BATF3Q9NR55 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BATF3Q9NR55 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BATF3Q9NR55 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BATF3Q9NR55 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BATF3Q9NR55 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BATF3Q9NR55 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BATF3Q9NR55 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BATF3Q9NR55 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BATF3Q9NR55 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BATF3Q9NR55 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BATF3Q9NR55 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BATF3Q9NR55 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
BATF3Q9NR55 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BATF3Q9NR55 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BATF3Q9NR55 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BATF3Q9NR55 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BATF3Q9NR55 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BATF3Q9NR55 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BATF3Q9NR55 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BATF3Q9NR55 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BATF3Q9NR55 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BATF3Q9NR55 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BATF3Q9NR55 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BATF3Q9NR55 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BATF3Q9NR55 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BATF3Q9NR55 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BATF3Q9NR55 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BATF3Q9NR55 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BATF3Q9NR55 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BATF3Q9NR55 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BATF3Q9NR55 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BATF3Q9NR55 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BATF3Q9NR55 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BATF3Q9NR55 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BATF3Q9NR55 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BATF3Q9NR55 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BATF3Q9NR55 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BATF3Q9NR55 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BATF3Q9NR55 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BATF3Q9NR55 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BATF3Q9NR55 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BATF3Q9NR55 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BATF3Q9NR55 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BATF3Q9NR55 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BATF3Q9NR55 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BATF3Q9NR55 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BATF3Q9NR55 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BATF3Q9NR55 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BATF3Q9NR55 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BATF3Q9NR55 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BATF3Q9NR55 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BATF3Q9NR55 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BATF3Q9NR55 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BATF3Q9NR55 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BATF3Q9NR55 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BATF3Q9NR55 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
BATF3Q9NR55 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
BATF3Q9NR55 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
BATF3Q9NR55 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
BATF3Q9NR55 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BATF3Q9NR55 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BATF3Q9NR55 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BATF3Q9NR55 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BATF3Q9NR55 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BATF3Q9NR55 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BATF3Q9NR55 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BATF3Q9NR55 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BATF3Q9NR55 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BATF3Q9NR55 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BATF3Q9NR55 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BATF3Q9NR55 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BATF3Q9NR55 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BATF3Q9NR55 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BATF3Q9NR55 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BATF3Q9NR55 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BATF3Q9NR55 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BATF3Q9NR55 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BATF3Q9NR55 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BATF3Q9NR55 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BATF3Q9NR55 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BATF3Q9NR55 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BATF3Q9NR55 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BATF3Q9NR55 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BATF3Q9NR55 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BATF3Q9NR55 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BATF3Q9NR55 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BATF3Q9NR55 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BATF3Q9NR55 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BATF3Q9NR55 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BATF3Q9NR55 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BATF3Q9NR55 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BATF3Q9NR55 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BATF3Q9NR55 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BATF3Q9NR55 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BATF3Q9NR55 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BATF3Q9NR55 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BATF3Q9NR55 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BATF3Q9NR55 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms