Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ69

LHX9, LIM/homeobox protein Lhx9, humanhuman

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX9Q9NQ69 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LHX9Q9NQ69 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LHX9Q9NQ69 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LHX9Q9NQ69 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LHX9Q9NQ69 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LHX9Q9NQ69 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LHX9Q9NQ69 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LHX9Q9NQ69 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LHX9Q9NQ69 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LHX9Q9NQ69 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LHX9Q9NQ69 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LHX9Q9NQ69 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LHX9Q9NQ69 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LHX9Q9NQ69 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LHX9Q9NQ69 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LHX9Q9NQ69 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LHX9Q9NQ69 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LHX9Q9NQ69 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LHX9Q9NQ69 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LHX9Q9NQ69 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LHX9Q9NQ69 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LHX9Q9NQ69 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LHX9Q9NQ69 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LHX9Q9NQ69 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LHX9Q9NQ69 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LHX9Q9NQ69 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LHX9Q9NQ69 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LHX9Q9NQ69 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LHX9Q9NQ69 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LHX9Q9NQ69 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LHX9Q9NQ69 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LHX9Q9NQ69 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LHX9Q9NQ69 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LHX9Q9NQ69 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LHX9Q9NQ69 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LHX9Q9NQ69 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LHX9Q9NQ69 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LHX9Q9NQ69 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
LHX9Q9NQ69 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LHX9Q9NQ69 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LHX9Q9NQ69 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LHX9Q9NQ69 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LHX9Q9NQ69 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LHX9Q9NQ69 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LHX9Q9NQ69 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LHX9Q9NQ69 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LHX9Q9NQ69 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
LHX9Q9NQ69 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LHX9Q9NQ69 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LHX9Q9NQ69 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LHX9Q9NQ69 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LHX9Q9NQ69 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LHX9Q9NQ69 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LHX9Q9NQ69 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LHX9Q9NQ69 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LHX9Q9NQ69 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LHX9Q9NQ69 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
LHX9Q9NQ69 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LHX9Q9NQ69 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LHX9Q9NQ69 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LHX9Q9NQ69 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LHX9Q9NQ69 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LHX9Q9NQ69 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LHX9Q9NQ69 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LHX9Q9NQ69 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LHX9Q9NQ69 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LHX9Q9NQ69 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LHX9Q9NQ69 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LHX9Q9NQ69 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LHX9Q9NQ69 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LHX9Q9NQ69 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LHX9Q9NQ69 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LHX9Q9NQ69 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
LHX9Q9NQ69 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LHX9Q9NQ69 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
LHX9Q9NQ69 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
LHX9Q9NQ69 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LHX9Q9NQ69 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LHX9Q9NQ69 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LHX9Q9NQ69 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LHX9Q9NQ69 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LHX9Q9NQ69 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LHX9Q9NQ69 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LHX9Q9NQ69 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LHX9Q9NQ69 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LHX9Q9NQ69 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LHX9Q9NQ69 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LHX9Q9NQ69 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LHX9Q9NQ69 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LHX9Q9NQ69 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LHX9Q9NQ69 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LHX9Q9NQ69 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LHX9Q9NQ69 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LHX9Q9NQ69 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LHX9Q9NQ69 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LHX9Q9NQ69 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LHX9Q9NQ69 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LHX9Q9NQ69 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LHX9Q9NQ69 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LHX9Q9NQ69 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms