Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC4

A4GALT, Lactosylceramide 4-alpha-galactosyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4GALTQ9NPC4 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
A4GALTQ9NPC4 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
A4GALTQ9NPC4 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
A4GALTQ9NPC4 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
A4GALTQ9NPC4 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
A4GALTQ9NPC4 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
A4GALTQ9NPC4 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
A4GALTQ9NPC4 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
A4GALTQ9NPC4 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
A4GALTQ9NPC4 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
A4GALTQ9NPC4 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
A4GALTQ9NPC4 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
A4GALTQ9NPC4 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
A4GALTQ9NPC4 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
A4GALTQ9NPC4 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
A4GALTQ9NPC4 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
A4GALTQ9NPC4 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
A4GALTQ9NPC4 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
A4GALTQ9NPC4 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
A4GALTQ9NPC4 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
A4GALTQ9NPC4 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
A4GALTQ9NPC4 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
A4GALTQ9NPC4 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
A4GALTQ9NPC4 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
A4GALTQ9NPC4 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
A4GALTQ9NPC4 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
A4GALTQ9NPC4 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
A4GALTQ9NPC4 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
A4GALTQ9NPC4 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
A4GALTQ9NPC4 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
A4GALTQ9NPC4 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
A4GALTQ9NPC4 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
A4GALTQ9NPC4 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
A4GALTQ9NPC4 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
A4GALTQ9NPC4 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
A4GALTQ9NPC4 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
A4GALTQ9NPC4 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
A4GALTQ9NPC4 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
A4GALTQ9NPC4 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
A4GALTQ9NPC4 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
A4GALTQ9NPC4 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
A4GALTQ9NPC4 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
A4GALTQ9NPC4 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
A4GALTQ9NPC4 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
A4GALTQ9NPC4 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
A4GALTQ9NPC4 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
A4GALTQ9NPC4 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
A4GALTQ9NPC4 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
A4GALTQ9NPC4 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
A4GALTQ9NPC4 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
A4GALTQ9NPC4 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
A4GALTQ9NPC4 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
A4GALTQ9NPC4 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
A4GALTQ9NPC4 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
A4GALTQ9NPC4 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
A4GALTQ9NPC4 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
A4GALTQ9NPC4 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
A4GALTQ9NPC4 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
A4GALTQ9NPC4 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
A4GALTQ9NPC4 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
A4GALTQ9NPC4 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
A4GALTQ9NPC4 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
A4GALTQ9NPC4 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
A4GALTQ9NPC4 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
A4GALTQ9NPC4 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
A4GALTQ9NPC4 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.42
A4GALTQ9NPC4 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
A4GALTQ9NPC4 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
A4GALTQ9NPC4 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
A4GALTQ9NPC4 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
A4GALTQ9NPC4 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
A4GALTQ9NPC4 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
A4GALTQ9NPC4 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
A4GALTQ9NPC4 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
A4GALTQ9NPC4 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
A4GALTQ9NPC4 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
A4GALTQ9NPC4 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
A4GALTQ9NPC4 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
A4GALTQ9NPC4 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
A4GALTQ9NPC4 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
A4GALTQ9NPC4 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
A4GALTQ9NPC4 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
A4GALTQ9NPC4 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
A4GALTQ9NPC4 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
A4GALTQ9NPC4 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
A4GALTQ9NPC4 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
A4GALTQ9NPC4 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
A4GALTQ9NPC4 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
A4GALTQ9NPC4 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
A4GALTQ9NPC4 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
A4GALTQ9NPC4 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
A4GALTQ9NPC4 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
A4GALTQ9NPC4 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
A4GALTQ9NPC4 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
A4GALTQ9NPC4 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
A4GALTQ9NPC4 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
A4GALTQ9NPC4 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
A4GALTQ9NPC4 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
A4GALTQ9NPC4 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
A4GALTQ9NPC4 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms