Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD26

GOPC, Golgi-associated PDZ and coiled-coil motif-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOPCQ9HD26 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GOPCQ9HD26 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GOPCQ9HD26 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GOPCQ9HD26 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GOPCQ9HD26 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GOPCQ9HD26 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GOPCQ9HD26 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GOPCQ9HD26 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GOPCQ9HD26 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GOPCQ9HD26 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GOPCQ9HD26 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GOPCQ9HD26 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
GOPCQ9HD26 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GOPCQ9HD26 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GOPCQ9HD26 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GOPCQ9HD26 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GOPCQ9HD26 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GOPCQ9HD26 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GOPCQ9HD26 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GOPCQ9HD26 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GOPCQ9HD26 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GOPCQ9HD26 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
GOPCQ9HD26 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
GOPCQ9HD26 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GOPCQ9HD26 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GOPCQ9HD26 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GOPCQ9HD26 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GOPCQ9HD26 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GOPCQ9HD26 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GOPCQ9HD26 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GOPCQ9HD26 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GOPCQ9HD26 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GOPCQ9HD26 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GOPCQ9HD26 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GOPCQ9HD26 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GOPCQ9HD26 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GOPCQ9HD26 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GOPCQ9HD26 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GOPCQ9HD26 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GOPCQ9HD26 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GOPCQ9HD26 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GOPCQ9HD26 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GOPCQ9HD26 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GOPCQ9HD26 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GOPCQ9HD26 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GOPCQ9HD26 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GOPCQ9HD26 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GOPCQ9HD26 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GOPCQ9HD26 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GOPCQ9HD26 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GOPCQ9HD26 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GOPCQ9HD26 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GOPCQ9HD26 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GOPCQ9HD26 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GOPCQ9HD26 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GOPCQ9HD26 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GOPCQ9HD26 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GOPCQ9HD26 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GOPCQ9HD26 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GOPCQ9HD26 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GOPCQ9HD26 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GOPCQ9HD26 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GOPCQ9HD26 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GOPCQ9HD26 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GOPCQ9HD26 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GOPCQ9HD26 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GOPCQ9HD26 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GOPCQ9HD26 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GOPCQ9HD26 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GOPCQ9HD26 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GOPCQ9HD26 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GOPCQ9HD26 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GOPCQ9HD26 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GOPCQ9HD26 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GOPCQ9HD26 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GOPCQ9HD26 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GOPCQ9HD26 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GOPCQ9HD26 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GOPCQ9HD26 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GOPCQ9HD26 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GOPCQ9HD26 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GOPCQ9HD26 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GOPCQ9HD26 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GOPCQ9HD26 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
GOPCQ9HD26 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GOPCQ9HD26 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GOPCQ9HD26 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GOPCQ9HD26 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
GOPCQ9HD26 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GOPCQ9HD26 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GOPCQ9HD26 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GOPCQ9HD26 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GOPCQ9HD26 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GOPCQ9HD26 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GOPCQ9HD26 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GOPCQ9HD26 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GOPCQ9HD26 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GOPCQ9HD26 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GOPCQ9HD26 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
GOPCQ9HD26 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms