Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCJ0

TNRC6C, Trinucleotide repeat-containing gene 6C protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNRC6CQ9HCJ0 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNRC6CQ9HCJ0 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNRC6CQ9HCJ0 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNRC6CQ9HCJ0 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNRC6CQ9HCJ0 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNRC6CQ9HCJ0 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNRC6CQ9HCJ0 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNRC6CQ9HCJ0 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNRC6CQ9HCJ0 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNRC6CQ9HCJ0 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNRC6CQ9HCJ0 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNRC6CQ9HCJ0 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNRC6CQ9HCJ0 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNRC6CQ9HCJ0 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNRC6CQ9HCJ0 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNRC6CQ9HCJ0 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNRC6CQ9HCJ0 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNRC6CQ9HCJ0 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNRC6CQ9HCJ0 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNRC6CQ9HCJ0 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNRC6CQ9HCJ0 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNRC6CQ9HCJ0 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNRC6CQ9HCJ0 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNRC6CQ9HCJ0 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNRC6CQ9HCJ0 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TNRC6CQ9HCJ0 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TNRC6CQ9HCJ0 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNRC6CQ9HCJ0 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNRC6CQ9HCJ0 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNRC6CQ9HCJ0 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TNRC6CQ9HCJ0 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNRC6CQ9HCJ0 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNRC6CQ9HCJ0 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNRC6CQ9HCJ0 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNRC6CQ9HCJ0 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TNRC6CQ9HCJ0 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNRC6CQ9HCJ0 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNRC6CQ9HCJ0 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNRC6CQ9HCJ0 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNRC6CQ9HCJ0 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNRC6CQ9HCJ0 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNRC6CQ9HCJ0 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNRC6CQ9HCJ0 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNRC6CQ9HCJ0 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNRC6CQ9HCJ0 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNRC6CQ9HCJ0 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNRC6CQ9HCJ0 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNRC6CQ9HCJ0 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNRC6CQ9HCJ0 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNRC6CQ9HCJ0 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNRC6CQ9HCJ0 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNRC6CQ9HCJ0 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNRC6CQ9HCJ0 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNRC6CQ9HCJ0 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNRC6CQ9HCJ0 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNRC6CQ9HCJ0 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNRC6CQ9HCJ0 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNRC6CQ9HCJ0 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNRC6CQ9HCJ0 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNRC6CQ9HCJ0 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNRC6CQ9HCJ0 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNRC6CQ9HCJ0 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNRC6CQ9HCJ0 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TNRC6CQ9HCJ0 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNRC6CQ9HCJ0 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNRC6CQ9HCJ0 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNRC6CQ9HCJ0 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNRC6CQ9HCJ0 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNRC6CQ9HCJ0 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNRC6CQ9HCJ0 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNRC6CQ9HCJ0 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNRC6CQ9HCJ0 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNRC6CQ9HCJ0 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNRC6CQ9HCJ0 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNRC6CQ9HCJ0 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TNRC6CQ9HCJ0 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNRC6CQ9HCJ0 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNRC6CQ9HCJ0 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNRC6CQ9HCJ0 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNRC6CQ9HCJ0 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNRC6CQ9HCJ0 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNRC6CQ9HCJ0 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNRC6CQ9HCJ0 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNRC6CQ9HCJ0 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNRC6CQ9HCJ0 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNRC6CQ9HCJ0 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNRC6CQ9HCJ0 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNRC6CQ9HCJ0 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNRC6CQ9HCJ0 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNRC6CQ9HCJ0 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNRC6CQ9HCJ0 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNRC6CQ9HCJ0 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNRC6CQ9HCJ0 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNRC6CQ9HCJ0 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNRC6CQ9HCJ0 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNRC6CQ9HCJ0 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TNRC6CQ9HCJ0 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TNRC6CQ9HCJ0 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TNRC6CQ9HCJ0 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TNRC6CQ9HCJ0 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms