Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7N4

SCAF1, Splicing factor, arginine/serine-rich 19, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF1Q9H7N4 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SCAF1Q9H7N4 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
SCAF1Q9H7N4 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SCAF1Q9H7N4 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SCAF1Q9H7N4 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SCAF1Q9H7N4 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SCAF1Q9H7N4 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SCAF1Q9H7N4 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SCAF1Q9H7N4 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SCAF1Q9H7N4 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SCAF1Q9H7N4 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SCAF1Q9H7N4 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SCAF1Q9H7N4 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SCAF1Q9H7N4 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
SCAF1Q9H7N4 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SCAF1Q9H7N4 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SCAF1Q9H7N4 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SCAF1Q9H7N4 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SCAF1Q9H7N4 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SCAF1Q9H7N4 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SCAF1Q9H7N4 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SCAF1Q9H7N4 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SCAF1Q9H7N4 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SCAF1Q9H7N4 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SCAF1Q9H7N4 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SCAF1Q9H7N4 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SCAF1Q9H7N4 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SCAF1Q9H7N4 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SCAF1Q9H7N4 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SCAF1Q9H7N4 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
SCAF1Q9H7N4 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SCAF1Q9H7N4 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SCAF1Q9H7N4 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SCAF1Q9H7N4 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SCAF1Q9H7N4 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SCAF1Q9H7N4 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SCAF1Q9H7N4 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
SCAF1Q9H7N4 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SCAF1Q9H7N4 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SCAF1Q9H7N4 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SCAF1Q9H7N4 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SCAF1Q9H7N4 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SCAF1Q9H7N4 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SCAF1Q9H7N4 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SCAF1Q9H7N4 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SCAF1Q9H7N4 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SCAF1Q9H7N4 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SCAF1Q9H7N4 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SCAF1Q9H7N4 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
SCAF1Q9H7N4 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SCAF1Q9H7N4 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SCAF1Q9H7N4 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SCAF1Q9H7N4 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
SCAF1Q9H7N4 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
SCAF1Q9H7N4 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
SCAF1Q9H7N4 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SCAF1Q9H7N4 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SCAF1Q9H7N4 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SCAF1Q9H7N4 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SCAF1Q9H7N4 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SCAF1Q9H7N4 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SCAF1Q9H7N4 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SCAF1Q9H7N4 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SCAF1Q9H7N4 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SCAF1Q9H7N4 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SCAF1Q9H7N4 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SCAF1Q9H7N4 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SCAF1Q9H7N4 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SCAF1Q9H7N4 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SCAF1Q9H7N4 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SCAF1Q9H7N4 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SCAF1Q9H7N4 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SCAF1Q9H7N4 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SCAF1Q9H7N4 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SCAF1Q9H7N4 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SCAF1Q9H7N4 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SCAF1Q9H7N4 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SCAF1Q9H7N4 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SCAF1Q9H7N4 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SCAF1Q9H7N4 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SCAF1Q9H7N4 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
SCAF1Q9H7N4 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SCAF1Q9H7N4 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SCAF1Q9H7N4 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SCAF1Q9H7N4 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SCAF1Q9H7N4 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SCAF1Q9H7N4 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SCAF1Q9H7N4 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SCAF1Q9H7N4 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SCAF1Q9H7N4 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SCAF1Q9H7N4 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SCAF1Q9H7N4 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
SCAF1Q9H7N4 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SCAF1Q9H7N4 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
SCAF1Q9H7N4 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
SCAF1Q9H7N4 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
SCAF1Q9H7N4 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
SCAF1Q9H7N4 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
SCAF1Q9H7N4 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
SCAF1Q9H7N4 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms