Protein–RNA interactions for Protein: Q9C099

LRRCC1, Leucine-rich repeat and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRCC1Q9C099 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRCC1Q9C099 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRCC1Q9C099 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRCC1Q9C099 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRCC1Q9C099 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRCC1Q9C099 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRCC1Q9C099 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRCC1Q9C099 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRCC1Q9C099 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRCC1Q9C099 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRCC1Q9C099 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRCC1Q9C099 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRCC1Q9C099 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRCC1Q9C099 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRCC1Q9C099 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRCC1Q9C099 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRCC1Q9C099 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRCC1Q9C099 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRCC1Q9C099 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRCC1Q9C099 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRCC1Q9C099 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRCC1Q9C099 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRCC1Q9C099 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRCC1Q9C099 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRCC1Q9C099 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRCC1Q9C099 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRCC1Q9C099 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRCC1Q9C099 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRCC1Q9C099 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRCC1Q9C099 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRCC1Q9C099 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRCC1Q9C099 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRCC1Q9C099 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRCC1Q9C099 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRCC1Q9C099 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRCC1Q9C099 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRCC1Q9C099 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRCC1Q9C099 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRCC1Q9C099 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRCC1Q9C099 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRCC1Q9C099 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRCC1Q9C099 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRCC1Q9C099 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRCC1Q9C099 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRCC1Q9C099 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRCC1Q9C099 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRCC1Q9C099 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRCC1Q9C099 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRCC1Q9C099 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRCC1Q9C099 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRCC1Q9C099 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRCC1Q9C099 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRCC1Q9C099 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRCC1Q9C099 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRCC1Q9C099 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRCC1Q9C099 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRCC1Q9C099 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRCC1Q9C099 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRCC1Q9C099 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRCC1Q9C099 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRCC1Q9C099 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRCC1Q9C099 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRCC1Q9C099 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRCC1Q9C099 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRCC1Q9C099 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRCC1Q9C099 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRCC1Q9C099 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRCC1Q9C099 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRCC1Q9C099 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRCC1Q9C099 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRCC1Q9C099 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRCC1Q9C099 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRCC1Q9C099 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRCC1Q9C099 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRCC1Q9C099 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRCC1Q9C099 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRCC1Q9C099 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRCC1Q9C099 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRCC1Q9C099 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRCC1Q9C099 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRCC1Q9C099 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRCC1Q9C099 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRCC1Q9C099 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRCC1Q9C099 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRCC1Q9C099 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
LRRCC1Q9C099 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LRRCC1Q9C099 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LRRCC1Q9C099 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LRRCC1Q9C099 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LRRCC1Q9C099 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
LRRCC1Q9C099 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
LRRCC1Q9C099 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
LRRCC1Q9C099 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
LRRCC1Q9C099 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRRCC1Q9C099 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRRCC1Q9C099 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
LRRCC1Q9C099 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
LRRCC1Q9C099 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRRCC1Q9C099 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRRCC1Q9C099 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms