Protein–RNA interactions for Protein: Q9C093

SPEF2, Sperm flagellar protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,822 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPEF2Q9C093 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPEF2Q9C093 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPEF2Q9C093 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPEF2Q9C093 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SPEF2Q9C093 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SPEF2Q9C093 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SPEF2Q9C093 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SPEF2Q9C093 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SPEF2Q9C093 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SPEF2Q9C093 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SPEF2Q9C093 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SPEF2Q9C093 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SPEF2Q9C093 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SPEF2Q9C093 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SPEF2Q9C093 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SPEF2Q9C093 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SPEF2Q9C093 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SPEF2Q9C093 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SPEF2Q9C093 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SPEF2Q9C093 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SPEF2Q9C093 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SPEF2Q9C093 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPEF2Q9C093 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPEF2Q9C093 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPEF2Q9C093 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPEF2Q9C093 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPEF2Q9C093 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPEF2Q9C093 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPEF2Q9C093 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPEF2Q9C093 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPEF2Q9C093 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPEF2Q9C093 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPEF2Q9C093 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPEF2Q9C093 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPEF2Q9C093 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SPEF2Q9C093 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SPEF2Q9C093 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPEF2Q9C093 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPEF2Q9C093 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPEF2Q9C093 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPEF2Q9C093 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SPEF2Q9C093 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPEF2Q9C093 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPEF2Q9C093 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPEF2Q9C093 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPEF2Q9C093 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPEF2Q9C093 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPEF2Q9C093 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SPEF2Q9C093 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPEF2Q9C093 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPEF2Q9C093 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPEF2Q9C093 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPEF2Q9C093 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPEF2Q9C093 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPEF2Q9C093 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPEF2Q9C093 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPEF2Q9C093 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPEF2Q9C093 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPEF2Q9C093 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPEF2Q9C093 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPEF2Q9C093 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPEF2Q9C093 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPEF2Q9C093 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SPEF2Q9C093 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPEF2Q9C093 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SPEF2Q9C093 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPEF2Q9C093 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPEF2Q9C093 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPEF2Q9C093 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPEF2Q9C093 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPEF2Q9C093 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPEF2Q9C093 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPEF2Q9C093 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPEF2Q9C093 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPEF2Q9C093 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPEF2Q9C093 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPEF2Q9C093 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPEF2Q9C093 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPEF2Q9C093 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPEF2Q9C093 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPEF2Q9C093 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPEF2Q9C093 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPEF2Q9C093 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPEF2Q9C093 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPEF2Q9C093 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPEF2Q9C093 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPEF2Q9C093 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPEF2Q9C093 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SPEF2Q9C093 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SPEF2Q9C093 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPEF2Q9C093 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPEF2Q9C093 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPEF2Q9C093 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPEF2Q9C093 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPEF2Q9C093 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPEF2Q9C093 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPEF2Q9C093 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPEF2Q9C093 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPEF2Q9C093 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPEF2Q9C093 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms