Protein–RNA interactions for Protein: Q9C000

NLRP1, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP1Q9C000 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
NLRP1Q9C000 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
NLRP1Q9C000 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NLRP1Q9C000 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NLRP1Q9C000 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NLRP1Q9C000 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NLRP1Q9C000 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NLRP1Q9C000 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NLRP1Q9C000 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NLRP1Q9C000 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NLRP1Q9C000 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NLRP1Q9C000 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NLRP1Q9C000 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NLRP1Q9C000 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NLRP1Q9C000 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NLRP1Q9C000 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NLRP1Q9C000 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NLRP1Q9C000 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NLRP1Q9C000 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NLRP1Q9C000 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NLRP1Q9C000 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
NLRP1Q9C000 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NLRP1Q9C000 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NLRP1Q9C000 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NLRP1Q9C000 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NLRP1Q9C000 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NLRP1Q9C000 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NLRP1Q9C000 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NLRP1Q9C000 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NLRP1Q9C000 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NLRP1Q9C000 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NLRP1Q9C000 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
NLRP1Q9C000 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NLRP1Q9C000 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NLRP1Q9C000 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
NLRP1Q9C000 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
NLRP1Q9C000 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NLRP1Q9C000 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NLRP1Q9C000 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NLRP1Q9C000 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NLRP1Q9C000 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
NLRP1Q9C000 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NLRP1Q9C000 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NLRP1Q9C000 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
NLRP1Q9C000 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NLRP1Q9C000 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NLRP1Q9C000 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NLRP1Q9C000 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NLRP1Q9C000 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NLRP1Q9C000 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
NLRP1Q9C000 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
NLRP1Q9C000 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
NLRP1Q9C000 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NLRP1Q9C000 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NLRP1Q9C000 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NLRP1Q9C000 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NLRP1Q9C000 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NLRP1Q9C000 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NLRP1Q9C000 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NLRP1Q9C000 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NLRP1Q9C000 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
NLRP1Q9C000 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NLRP1Q9C000 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NLRP1Q9C000 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NLRP1Q9C000 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
NLRP1Q9C000 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NLRP1Q9C000 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
NLRP1Q9C000 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NLRP1Q9C000 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
NLRP1Q9C000 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
NLRP1Q9C000 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NLRP1Q9C000 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NLRP1Q9C000 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NLRP1Q9C000 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NLRP1Q9C000 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NLRP1Q9C000 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NLRP1Q9C000 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NLRP1Q9C000 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NLRP1Q9C000 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NLRP1Q9C000 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
NLRP1Q9C000 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NLRP1Q9C000 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
NLRP1Q9C000 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NLRP1Q9C000 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NLRP1Q9C000 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NLRP1Q9C000 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NLRP1Q9C000 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NLRP1Q9C000 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NLRP1Q9C000 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NLRP1Q9C000 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NLRP1Q9C000 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NLRP1Q9C000 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NLRP1Q9C000 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
NLRP1Q9C000 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NLRP1Q9C000 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NLRP1Q9C000 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NLRP1Q9C000 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NLRP1Q9C000 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NLRP1Q9C000 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NLRP1Q9C000 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms