Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV2

TRIM54, Tripartite motif-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM54Q9BYV2 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIM54Q9BYV2 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIM54Q9BYV2 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIM54Q9BYV2 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIM54Q9BYV2 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIM54Q9BYV2 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIM54Q9BYV2 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIM54Q9BYV2 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIM54Q9BYV2 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIM54Q9BYV2 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIM54Q9BYV2 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIM54Q9BYV2 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIM54Q9BYV2 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIM54Q9BYV2 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIM54Q9BYV2 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIM54Q9BYV2 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIM54Q9BYV2 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIM54Q9BYV2 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIM54Q9BYV2 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIM54Q9BYV2 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIM54Q9BYV2 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIM54Q9BYV2 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIM54Q9BYV2 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIM54Q9BYV2 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIM54Q9BYV2 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIM54Q9BYV2 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIM54Q9BYV2 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIM54Q9BYV2 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIM54Q9BYV2 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIM54Q9BYV2 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIM54Q9BYV2 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIM54Q9BYV2 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRIM54Q9BYV2 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRIM54Q9BYV2 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRIM54Q9BYV2 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRIM54Q9BYV2 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRIM54Q9BYV2 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRIM54Q9BYV2 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRIM54Q9BYV2 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRIM54Q9BYV2 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRIM54Q9BYV2 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
TRIM54Q9BYV2 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRIM54Q9BYV2 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRIM54Q9BYV2 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRIM54Q9BYV2 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
TRIM54Q9BYV2 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRIM54Q9BYV2 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRIM54Q9BYV2 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRIM54Q9BYV2 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRIM54Q9BYV2 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRIM54Q9BYV2 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRIM54Q9BYV2 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRIM54Q9BYV2 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM54Q9BYV2 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM54Q9BYV2 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM54Q9BYV2 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM54Q9BYV2 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM54Q9BYV2 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM54Q9BYV2 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM54Q9BYV2 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM54Q9BYV2 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM54Q9BYV2 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM54Q9BYV2 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM54Q9BYV2 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM54Q9BYV2 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM54Q9BYV2 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM54Q9BYV2 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM54Q9BYV2 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM54Q9BYV2 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM54Q9BYV2 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM54Q9BYV2 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM54Q9BYV2 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM54Q9BYV2 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM54Q9BYV2 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM54Q9BYV2 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM54Q9BYV2 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM54Q9BYV2 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM54Q9BYV2 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM54Q9BYV2 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM54Q9BYV2 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM54Q9BYV2 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM54Q9BYV2 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM54Q9BYV2 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM54Q9BYV2 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM54Q9BYV2 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM54Q9BYV2 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM54Q9BYV2 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM54Q9BYV2 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM54Q9BYV2 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM54Q9BYV2 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM54Q9BYV2 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM54Q9BYV2 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM54Q9BYV2 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM54Q9BYV2 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM54Q9BYV2 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM54Q9BYV2 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM54Q9BYV2 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM54Q9BYV2 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM54Q9BYV2 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM54Q9BYV2 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms