Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXA9

SALL3, Sal-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL3Q9BXA9 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SALL3Q9BXA9 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SALL3Q9BXA9 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SALL3Q9BXA9 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SALL3Q9BXA9 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SALL3Q9BXA9 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SALL3Q9BXA9 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SALL3Q9BXA9 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SALL3Q9BXA9 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SALL3Q9BXA9 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SALL3Q9BXA9 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SALL3Q9BXA9 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SALL3Q9BXA9 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SALL3Q9BXA9 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SALL3Q9BXA9 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SALL3Q9BXA9 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SALL3Q9BXA9 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SALL3Q9BXA9 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SALL3Q9BXA9 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SALL3Q9BXA9 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SALL3Q9BXA9 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SALL3Q9BXA9 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SALL3Q9BXA9 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SALL3Q9BXA9 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SALL3Q9BXA9 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SALL3Q9BXA9 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SALL3Q9BXA9 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SALL3Q9BXA9 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SALL3Q9BXA9 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SALL3Q9BXA9 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SALL3Q9BXA9 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SALL3Q9BXA9 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SALL3Q9BXA9 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SALL3Q9BXA9 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SALL3Q9BXA9 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SALL3Q9BXA9 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SALL3Q9BXA9 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SALL3Q9BXA9 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SALL3Q9BXA9 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SALL3Q9BXA9 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SALL3Q9BXA9 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SALL3Q9BXA9 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SALL3Q9BXA9 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SALL3Q9BXA9 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SALL3Q9BXA9 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SALL3Q9BXA9 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SALL3Q9BXA9 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SALL3Q9BXA9 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SALL3Q9BXA9 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SALL3Q9BXA9 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SALL3Q9BXA9 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SALL3Q9BXA9 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SALL3Q9BXA9 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SALL3Q9BXA9 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SALL3Q9BXA9 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SALL3Q9BXA9 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SALL3Q9BXA9 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SALL3Q9BXA9 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SALL3Q9BXA9 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SALL3Q9BXA9 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SALL3Q9BXA9 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SALL3Q9BXA9 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SALL3Q9BXA9 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SALL3Q9BXA9 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SALL3Q9BXA9 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SALL3Q9BXA9 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SALL3Q9BXA9 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SALL3Q9BXA9 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SALL3Q9BXA9 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SALL3Q9BXA9 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SALL3Q9BXA9 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SALL3Q9BXA9 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SALL3Q9BXA9 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SALL3Q9BXA9 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SALL3Q9BXA9 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SALL3Q9BXA9 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SALL3Q9BXA9 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SALL3Q9BXA9 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SALL3Q9BXA9 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SALL3Q9BXA9 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SALL3Q9BXA9 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SALL3Q9BXA9 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SALL3Q9BXA9 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SALL3Q9BXA9 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SALL3Q9BXA9 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SALL3Q9BXA9 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SALL3Q9BXA9 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SALL3Q9BXA9 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SALL3Q9BXA9 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SALL3Q9BXA9 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SALL3Q9BXA9 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SALL3Q9BXA9 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SALL3Q9BXA9 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SALL3Q9BXA9 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SALL3Q9BXA9 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SALL3Q9BXA9 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SALL3Q9BXA9 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SALL3Q9BXA9 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SALL3Q9BXA9 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SALL3Q9BXA9 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms