Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX26

SYCP2, Synaptonemal complex protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2Q9BX26 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SYCP2Q9BX26 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
SYCP2Q9BX26 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SYCP2Q9BX26 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SYCP2Q9BX26 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SYCP2Q9BX26 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SYCP2Q9BX26 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SYCP2Q9BX26 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SYCP2Q9BX26 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SYCP2Q9BX26 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SYCP2Q9BX26 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
SYCP2Q9BX26 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SYCP2Q9BX26 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SYCP2Q9BX26 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SYCP2Q9BX26 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SYCP2Q9BX26 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SYCP2Q9BX26 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SYCP2Q9BX26 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SYCP2Q9BX26 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SYCP2Q9BX26 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SYCP2Q9BX26 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
SYCP2Q9BX26 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SYCP2Q9BX26 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
SYCP2Q9BX26 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SYCP2Q9BX26 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SYCP2Q9BX26 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SYCP2Q9BX26 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
SYCP2Q9BX26 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SYCP2Q9BX26 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SYCP2Q9BX26 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SYCP2Q9BX26 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
SYCP2Q9BX26 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SYCP2Q9BX26 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SYCP2Q9BX26 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SYCP2Q9BX26 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SYCP2Q9BX26 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SYCP2Q9BX26 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SYCP2Q9BX26 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SYCP2Q9BX26 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SYCP2Q9BX26 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SYCP2Q9BX26 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SYCP2Q9BX26 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SYCP2Q9BX26 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SYCP2Q9BX26 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SYCP2Q9BX26 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SYCP2Q9BX26 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SYCP2Q9BX26 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SYCP2Q9BX26 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SYCP2Q9BX26 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SYCP2Q9BX26 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SYCP2Q9BX26 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SYCP2Q9BX26 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SYCP2Q9BX26 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SYCP2Q9BX26 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SYCP2Q9BX26 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SYCP2Q9BX26 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SYCP2Q9BX26 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SYCP2Q9BX26 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SYCP2Q9BX26 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SYCP2Q9BX26 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
SYCP2Q9BX26 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SYCP2Q9BX26 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SYCP2Q9BX26 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SYCP2Q9BX26 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SYCP2Q9BX26 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
SYCP2Q9BX26 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SYCP2Q9BX26 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SYCP2Q9BX26 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SYCP2Q9BX26 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SYCP2Q9BX26 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SYCP2Q9BX26 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
SYCP2Q9BX26 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SYCP2Q9BX26 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SYCP2Q9BX26 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SYCP2Q9BX26 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SYCP2Q9BX26 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SYCP2Q9BX26 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SYCP2Q9BX26 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SYCP2Q9BX26 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SYCP2Q9BX26 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SYCP2Q9BX26 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SYCP2Q9BX26 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SYCP2Q9BX26 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SYCP2Q9BX26 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SYCP2Q9BX26 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SYCP2Q9BX26 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SYCP2Q9BX26 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
SYCP2Q9BX26 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
SYCP2Q9BX26 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SYCP2Q9BX26 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SYCP2Q9BX26 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
SYCP2Q9BX26 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SYCP2Q9BX26 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SYCP2Q9BX26 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SYCP2Q9BX26 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SYCP2Q9BX26 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SYCP2Q9BX26 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SYCP2Q9BX26 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SYCP2Q9BX26 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SYCP2Q9BX26 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms