Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA0

KATNB1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KATNB1Q9BVA0 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KATNB1Q9BVA0 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KATNB1Q9BVA0 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KATNB1Q9BVA0 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KATNB1Q9BVA0 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KATNB1Q9BVA0 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KATNB1Q9BVA0 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KATNB1Q9BVA0 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KATNB1Q9BVA0 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
KATNB1Q9BVA0 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KATNB1Q9BVA0 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KATNB1Q9BVA0 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KATNB1Q9BVA0 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KATNB1Q9BVA0 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KATNB1Q9BVA0 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KATNB1Q9BVA0 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KATNB1Q9BVA0 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KATNB1Q9BVA0 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KATNB1Q9BVA0 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KATNB1Q9BVA0 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KATNB1Q9BVA0 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KATNB1Q9BVA0 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KATNB1Q9BVA0 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KATNB1Q9BVA0 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KATNB1Q9BVA0 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KATNB1Q9BVA0 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
KATNB1Q9BVA0 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KATNB1Q9BVA0 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KATNB1Q9BVA0 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KATNB1Q9BVA0 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KATNB1Q9BVA0 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KATNB1Q9BVA0 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KATNB1Q9BVA0 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KATNB1Q9BVA0 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KATNB1Q9BVA0 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
KATNB1Q9BVA0 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KATNB1Q9BVA0 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KATNB1Q9BVA0 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KATNB1Q9BVA0 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KATNB1Q9BVA0 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KATNB1Q9BVA0 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KATNB1Q9BVA0 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KATNB1Q9BVA0 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KATNB1Q9BVA0 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KATNB1Q9BVA0 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KATNB1Q9BVA0 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KATNB1Q9BVA0 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KATNB1Q9BVA0 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KATNB1Q9BVA0 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KATNB1Q9BVA0 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KATNB1Q9BVA0 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KATNB1Q9BVA0 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KATNB1Q9BVA0 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
KATNB1Q9BVA0 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KATNB1Q9BVA0 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KATNB1Q9BVA0 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KATNB1Q9BVA0 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KATNB1Q9BVA0 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KATNB1Q9BVA0 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KATNB1Q9BVA0 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KATNB1Q9BVA0 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KATNB1Q9BVA0 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KATNB1Q9BVA0 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KATNB1Q9BVA0 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KATNB1Q9BVA0 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KATNB1Q9BVA0 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KATNB1Q9BVA0 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KATNB1Q9BVA0 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KATNB1Q9BVA0 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
KATNB1Q9BVA0 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
KATNB1Q9BVA0 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KATNB1Q9BVA0 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KATNB1Q9BVA0 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KATNB1Q9BVA0 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KATNB1Q9BVA0 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KATNB1Q9BVA0 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KATNB1Q9BVA0 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KATNB1Q9BVA0 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KATNB1Q9BVA0 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KATNB1Q9BVA0 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KATNB1Q9BVA0 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KATNB1Q9BVA0 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KATNB1Q9BVA0 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KATNB1Q9BVA0 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
KATNB1Q9BVA0 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KATNB1Q9BVA0 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KATNB1Q9BVA0 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KATNB1Q9BVA0 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KATNB1Q9BVA0 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KATNB1Q9BVA0 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KATNB1Q9BVA0 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KATNB1Q9BVA0 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KATNB1Q9BVA0 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KATNB1Q9BVA0 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KATNB1Q9BVA0 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KATNB1Q9BVA0 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KATNB1Q9BVA0 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KATNB1Q9BVA0 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KATNB1Q9BVA0 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KATNB1Q9BVA0 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms