Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV87

CNPPD1, Protein CNPPD1, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNPPD1Q9BV87 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CNPPD1Q9BV87 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CNPPD1Q9BV87 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CNPPD1Q9BV87 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CNPPD1Q9BV87 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CNPPD1Q9BV87 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CNPPD1Q9BV87 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CNPPD1Q9BV87 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CNPPD1Q9BV87 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CNPPD1Q9BV87 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CNPPD1Q9BV87 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CNPPD1Q9BV87 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CNPPD1Q9BV87 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CNPPD1Q9BV87 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CNPPD1Q9BV87 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CNPPD1Q9BV87 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CNPPD1Q9BV87 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CNPPD1Q9BV87 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CNPPD1Q9BV87 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CNPPD1Q9BV87 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CNPPD1Q9BV87 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CNPPD1Q9BV87 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CNPPD1Q9BV87 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CNPPD1Q9BV87 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CNPPD1Q9BV87 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CNPPD1Q9BV87 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CNPPD1Q9BV87 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CNPPD1Q9BV87 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CNPPD1Q9BV87 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CNPPD1Q9BV87 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CNPPD1Q9BV87 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CNPPD1Q9BV87 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CNPPD1Q9BV87 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CNPPD1Q9BV87 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CNPPD1Q9BV87 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CNPPD1Q9BV87 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CNPPD1Q9BV87 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CNPPD1Q9BV87 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CNPPD1Q9BV87 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CNPPD1Q9BV87 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CNPPD1Q9BV87 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CNPPD1Q9BV87 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CNPPD1Q9BV87 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CNPPD1Q9BV87 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CNPPD1Q9BV87 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CNPPD1Q9BV87 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CNPPD1Q9BV87 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CNPPD1Q9BV87 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CNPPD1Q9BV87 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CNPPD1Q9BV87 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CNPPD1Q9BV87 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CNPPD1Q9BV87 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CNPPD1Q9BV87 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CNPPD1Q9BV87 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CNPPD1Q9BV87 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CNPPD1Q9BV87 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CNPPD1Q9BV87 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CNPPD1Q9BV87 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CNPPD1Q9BV87 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CNPPD1Q9BV87 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CNPPD1Q9BV87 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CNPPD1Q9BV87 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CNPPD1Q9BV87 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CNPPD1Q9BV87 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CNPPD1Q9BV87 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CNPPD1Q9BV87 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CNPPD1Q9BV87 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CNPPD1Q9BV87 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CNPPD1Q9BV87 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CNPPD1Q9BV87 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CNPPD1Q9BV87 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CNPPD1Q9BV87 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CNPPD1Q9BV87 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CNPPD1Q9BV87 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CNPPD1Q9BV87 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CNPPD1Q9BV87 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CNPPD1Q9BV87 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CNPPD1Q9BV87 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CNPPD1Q9BV87 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CNPPD1Q9BV87 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CNPPD1Q9BV87 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNPPD1Q9BV87 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNPPD1Q9BV87 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNPPD1Q9BV87 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNPPD1Q9BV87 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNPPD1Q9BV87 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNPPD1Q9BV87 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNPPD1Q9BV87 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNPPD1Q9BV87 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNPPD1Q9BV87 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNPPD1Q9BV87 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNPPD1Q9BV87 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CNPPD1Q9BV87 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNPPD1Q9BV87 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNPPD1Q9BV87 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNPPD1Q9BV87 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNPPD1Q9BV87 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNPPD1Q9BV87 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNPPD1Q9BV87 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNPPD1Q9BV87 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms