Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUZ4

TRAF4, TNF receptor-associated factor 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF4Q9BUZ4 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAF4Q9BUZ4 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAF4Q9BUZ4 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAF4Q9BUZ4 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAF4Q9BUZ4 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAF4Q9BUZ4 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAF4Q9BUZ4 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAF4Q9BUZ4 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAF4Q9BUZ4 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAF4Q9BUZ4 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAF4Q9BUZ4 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAF4Q9BUZ4 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAF4Q9BUZ4 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAF4Q9BUZ4 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAF4Q9BUZ4 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAF4Q9BUZ4 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAF4Q9BUZ4 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAF4Q9BUZ4 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAF4Q9BUZ4 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAF4Q9BUZ4 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAF4Q9BUZ4 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAF4Q9BUZ4 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAF4Q9BUZ4 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAF4Q9BUZ4 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAF4Q9BUZ4 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAF4Q9BUZ4 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAF4Q9BUZ4 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAF4Q9BUZ4 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAF4Q9BUZ4 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAF4Q9BUZ4 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAF4Q9BUZ4 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAF4Q9BUZ4 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAF4Q9BUZ4 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAF4Q9BUZ4 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAF4Q9BUZ4 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAF4Q9BUZ4 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAF4Q9BUZ4 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAF4Q9BUZ4 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAF4Q9BUZ4 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRAF4Q9BUZ4 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRAF4Q9BUZ4 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRAF4Q9BUZ4 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRAF4Q9BUZ4 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRAF4Q9BUZ4 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TRAF4Q9BUZ4 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRAF4Q9BUZ4 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRAF4Q9BUZ4 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRAF4Q9BUZ4 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRAF4Q9BUZ4 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRAF4Q9BUZ4 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRAF4Q9BUZ4 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRAF4Q9BUZ4 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRAF4Q9BUZ4 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRAF4Q9BUZ4 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRAF4Q9BUZ4 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRAF4Q9BUZ4 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRAF4Q9BUZ4 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRAF4Q9BUZ4 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRAF4Q9BUZ4 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRAF4Q9BUZ4 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRAF4Q9BUZ4 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRAF4Q9BUZ4 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRAF4Q9BUZ4 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRAF4Q9BUZ4 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRAF4Q9BUZ4 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRAF4Q9BUZ4 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRAF4Q9BUZ4 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRAF4Q9BUZ4 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRAF4Q9BUZ4 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRAF4Q9BUZ4 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRAF4Q9BUZ4 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRAF4Q9BUZ4 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRAF4Q9BUZ4 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
TRAF4Q9BUZ4 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRAF4Q9BUZ4 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRAF4Q9BUZ4 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRAF4Q9BUZ4 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRAF4Q9BUZ4 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRAF4Q9BUZ4 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRAF4Q9BUZ4 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRAF4Q9BUZ4 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRAF4Q9BUZ4 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRAF4Q9BUZ4 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRAF4Q9BUZ4 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
TRAF4Q9BUZ4 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRAF4Q9BUZ4 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRAF4Q9BUZ4 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
TRAF4Q9BUZ4 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
TRAF4Q9BUZ4 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
TRAF4Q9BUZ4 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
TRAF4Q9BUZ4 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
TRAF4Q9BUZ4 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
TRAF4Q9BUZ4 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
TRAF4Q9BUZ4 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
TRAF4Q9BUZ4 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
TRAF4Q9BUZ4 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRAF4Q9BUZ4 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRAF4Q9BUZ4 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRAF4Q9BUZ4 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRAF4Q9BUZ4 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms