Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTC8

MTA3, Metastasis-associated protein MTA3, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTA3Q9BTC8 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MTA3Q9BTC8 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MTA3Q9BTC8 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MTA3Q9BTC8 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MTA3Q9BTC8 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MTA3Q9BTC8 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MTA3Q9BTC8 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MTA3Q9BTC8 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MTA3Q9BTC8 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MTA3Q9BTC8 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MTA3Q9BTC8 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MTA3Q9BTC8 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MTA3Q9BTC8 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MTA3Q9BTC8 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MTA3Q9BTC8 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MTA3Q9BTC8 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MTA3Q9BTC8 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MTA3Q9BTC8 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MTA3Q9BTC8 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MTA3Q9BTC8 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MTA3Q9BTC8 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MTA3Q9BTC8 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MTA3Q9BTC8 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MTA3Q9BTC8 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MTA3Q9BTC8 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MTA3Q9BTC8 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MTA3Q9BTC8 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MTA3Q9BTC8 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
MTA3Q9BTC8 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
MTA3Q9BTC8 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MTA3Q9BTC8 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MTA3Q9BTC8 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
MTA3Q9BTC8 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MTA3Q9BTC8 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MTA3Q9BTC8 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MTA3Q9BTC8 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
MTA3Q9BTC8 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MTA3Q9BTC8 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MTA3Q9BTC8 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MTA3Q9BTC8 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MTA3Q9BTC8 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MTA3Q9BTC8 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MTA3Q9BTC8 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MTA3Q9BTC8 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MTA3Q9BTC8 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MTA3Q9BTC8 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MTA3Q9BTC8 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MTA3Q9BTC8 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MTA3Q9BTC8 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
MTA3Q9BTC8 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MTA3Q9BTC8 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MTA3Q9BTC8 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MTA3Q9BTC8 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
MTA3Q9BTC8 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MTA3Q9BTC8 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MTA3Q9BTC8 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MTA3Q9BTC8 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MTA3Q9BTC8 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MTA3Q9BTC8 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MTA3Q9BTC8 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MTA3Q9BTC8 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MTA3Q9BTC8 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MTA3Q9BTC8 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MTA3Q9BTC8 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MTA3Q9BTC8 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MTA3Q9BTC8 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MTA3Q9BTC8 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MTA3Q9BTC8 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MTA3Q9BTC8 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MTA3Q9BTC8 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MTA3Q9BTC8 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MTA3Q9BTC8 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MTA3Q9BTC8 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
MTA3Q9BTC8 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
MTA3Q9BTC8 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
MTA3Q9BTC8 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MTA3Q9BTC8 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MTA3Q9BTC8 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MTA3Q9BTC8 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MTA3Q9BTC8 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MTA3Q9BTC8 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MTA3Q9BTC8 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MTA3Q9BTC8 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MTA3Q9BTC8 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MTA3Q9BTC8 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MTA3Q9BTC8 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MTA3Q9BTC8 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MTA3Q9BTC8 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
MTA3Q9BTC8 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MTA3Q9BTC8 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MTA3Q9BTC8 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MTA3Q9BTC8 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MTA3Q9BTC8 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MTA3Q9BTC8 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MTA3Q9BTC8 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MTA3Q9BTC8 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MTA3Q9BTC8 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MTA3Q9BTC8 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
MTA3Q9BTC8 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MTA3Q9BTC8 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms