Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSW7

SYT17, Synaptotagmin-17, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT17Q9BSW7 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYT17Q9BSW7 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYT17Q9BSW7 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYT17Q9BSW7 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYT17Q9BSW7 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYT17Q9BSW7 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYT17Q9BSW7 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYT17Q9BSW7 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYT17Q9BSW7 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYT17Q9BSW7 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYT17Q9BSW7 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SYT17Q9BSW7 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYT17Q9BSW7 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SYT17Q9BSW7 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYT17Q9BSW7 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYT17Q9BSW7 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYT17Q9BSW7 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYT17Q9BSW7 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYT17Q9BSW7 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYT17Q9BSW7 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYT17Q9BSW7 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SYT17Q9BSW7 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYT17Q9BSW7 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYT17Q9BSW7 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYT17Q9BSW7 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYT17Q9BSW7 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYT17Q9BSW7 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYT17Q9BSW7 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYT17Q9BSW7 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYT17Q9BSW7 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYT17Q9BSW7 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYT17Q9BSW7 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYT17Q9BSW7 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYT17Q9BSW7 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYT17Q9BSW7 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYT17Q9BSW7 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYT17Q9BSW7 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SYT17Q9BSW7 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYT17Q9BSW7 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYT17Q9BSW7 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYT17Q9BSW7 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SYT17Q9BSW7 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SYT17Q9BSW7 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SYT17Q9BSW7 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SYT17Q9BSW7 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SYT17Q9BSW7 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SYT17Q9BSW7 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SYT17Q9BSW7 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SYT17Q9BSW7 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SYT17Q9BSW7 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SYT17Q9BSW7 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SYT17Q9BSW7 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SYT17Q9BSW7 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SYT17Q9BSW7 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SYT17Q9BSW7 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SYT17Q9BSW7 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SYT17Q9BSW7 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYT17Q9BSW7 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYT17Q9BSW7 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYT17Q9BSW7 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYT17Q9BSW7 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYT17Q9BSW7 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYT17Q9BSW7 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYT17Q9BSW7 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYT17Q9BSW7 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYT17Q9BSW7 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYT17Q9BSW7 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYT17Q9BSW7 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYT17Q9BSW7 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYT17Q9BSW7 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYT17Q9BSW7 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYT17Q9BSW7 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SYT17Q9BSW7 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SYT17Q9BSW7 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYT17Q9BSW7 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYT17Q9BSW7 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SYT17Q9BSW7 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYT17Q9BSW7 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYT17Q9BSW7 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SYT17Q9BSW7 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYT17Q9BSW7 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYT17Q9BSW7 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYT17Q9BSW7 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SYT17Q9BSW7 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYT17Q9BSW7 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYT17Q9BSW7 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYT17Q9BSW7 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYT17Q9BSW7 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYT17Q9BSW7 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYT17Q9BSW7 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SYT17Q9BSW7 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYT17Q9BSW7 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYT17Q9BSW7 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYT17Q9BSW7 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYT17Q9BSW7 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYT17Q9BSW7 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYT17Q9BSW7 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYT17Q9BSW7 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYT17Q9BSW7 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYT17Q9BSW7 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms