Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSA9

TMEM175, Endosomal/lysosomal potassium channel TMEM175, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM175Q9BSA9 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM175Q9BSA9 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM175Q9BSA9 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM175Q9BSA9 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM175Q9BSA9 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM175Q9BSA9 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM175Q9BSA9 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM175Q9BSA9 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM175Q9BSA9 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM175Q9BSA9 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM175Q9BSA9 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM175Q9BSA9 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM175Q9BSA9 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM175Q9BSA9 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM175Q9BSA9 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM175Q9BSA9 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM175Q9BSA9 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM175Q9BSA9 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM175Q9BSA9 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM175Q9BSA9 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM175Q9BSA9 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM175Q9BSA9 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM175Q9BSA9 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM175Q9BSA9 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM175Q9BSA9 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM175Q9BSA9 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM175Q9BSA9 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM175Q9BSA9 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM175Q9BSA9 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM175Q9BSA9 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM175Q9BSA9 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM175Q9BSA9 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM175Q9BSA9 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM175Q9BSA9 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM175Q9BSA9 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM175Q9BSA9 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM175Q9BSA9 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM175Q9BSA9 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM175Q9BSA9 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM175Q9BSA9 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM175Q9BSA9 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM175Q9BSA9 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM175Q9BSA9 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM175Q9BSA9 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM175Q9BSA9 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM175Q9BSA9 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM175Q9BSA9 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM175Q9BSA9 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM175Q9BSA9 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM175Q9BSA9 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM175Q9BSA9 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM175Q9BSA9 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM175Q9BSA9 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM175Q9BSA9 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM175Q9BSA9 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM175Q9BSA9 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM175Q9BSA9 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM175Q9BSA9 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM175Q9BSA9 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM175Q9BSA9 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM175Q9BSA9 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM175Q9BSA9 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM175Q9BSA9 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM175Q9BSA9 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM175Q9BSA9 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM175Q9BSA9 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM175Q9BSA9 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM175Q9BSA9 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
TMEM175Q9BSA9 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
TMEM175Q9BSA9 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM175Q9BSA9 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM175Q9BSA9 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM175Q9BSA9 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM175Q9BSA9 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM175Q9BSA9 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM175Q9BSA9 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM175Q9BSA9 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM175Q9BSA9 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM175Q9BSA9 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM175Q9BSA9 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM175Q9BSA9 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM175Q9BSA9 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM175Q9BSA9 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM175Q9BSA9 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM175Q9BSA9 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM175Q9BSA9 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM175Q9BSA9 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM175Q9BSA9 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM175Q9BSA9 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM175Q9BSA9 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM175Q9BSA9 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM175Q9BSA9 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM175Q9BSA9 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM175Q9BSA9 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM175Q9BSA9 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM175Q9BSA9 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM175Q9BSA9 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM175Q9BSA9 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM175Q9BSA9 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM175Q9BSA9 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms