Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRK5

SDF4, 45 kDa calcium-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDF4Q9BRK5 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SDF4Q9BRK5 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SDF4Q9BRK5 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SDF4Q9BRK5 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SDF4Q9BRK5 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SDF4Q9BRK5 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SDF4Q9BRK5 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SDF4Q9BRK5 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SDF4Q9BRK5 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SDF4Q9BRK5 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SDF4Q9BRK5 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SDF4Q9BRK5 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SDF4Q9BRK5 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SDF4Q9BRK5 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SDF4Q9BRK5 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SDF4Q9BRK5 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SDF4Q9BRK5 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SDF4Q9BRK5 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SDF4Q9BRK5 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SDF4Q9BRK5 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SDF4Q9BRK5 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SDF4Q9BRK5 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SDF4Q9BRK5 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SDF4Q9BRK5 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SDF4Q9BRK5 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SDF4Q9BRK5 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SDF4Q9BRK5 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SDF4Q9BRK5 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SDF4Q9BRK5 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SDF4Q9BRK5 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SDF4Q9BRK5 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SDF4Q9BRK5 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SDF4Q9BRK5 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SDF4Q9BRK5 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SDF4Q9BRK5 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SDF4Q9BRK5 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SDF4Q9BRK5 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SDF4Q9BRK5 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SDF4Q9BRK5 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SDF4Q9BRK5 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SDF4Q9BRK5 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SDF4Q9BRK5 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SDF4Q9BRK5 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SDF4Q9BRK5 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SDF4Q9BRK5 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SDF4Q9BRK5 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SDF4Q9BRK5 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SDF4Q9BRK5 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SDF4Q9BRK5 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SDF4Q9BRK5 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SDF4Q9BRK5 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SDF4Q9BRK5 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SDF4Q9BRK5 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SDF4Q9BRK5 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SDF4Q9BRK5 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SDF4Q9BRK5 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SDF4Q9BRK5 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SDF4Q9BRK5 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SDF4Q9BRK5 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SDF4Q9BRK5 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SDF4Q9BRK5 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SDF4Q9BRK5 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SDF4Q9BRK5 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SDF4Q9BRK5 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SDF4Q9BRK5 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SDF4Q9BRK5 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SDF4Q9BRK5 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SDF4Q9BRK5 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SDF4Q9BRK5 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SDF4Q9BRK5 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SDF4Q9BRK5 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SDF4Q9BRK5 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SDF4Q9BRK5 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SDF4Q9BRK5 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SDF4Q9BRK5 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SDF4Q9BRK5 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SDF4Q9BRK5 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SDF4Q9BRK5 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SDF4Q9BRK5 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SDF4Q9BRK5 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SDF4Q9BRK5 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SDF4Q9BRK5 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SDF4Q9BRK5 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SDF4Q9BRK5 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SDF4Q9BRK5 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SDF4Q9BRK5 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SDF4Q9BRK5 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SDF4Q9BRK5 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SDF4Q9BRK5 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SDF4Q9BRK5 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SDF4Q9BRK5 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SDF4Q9BRK5 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SDF4Q9BRK5 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SDF4Q9BRK5 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SDF4Q9BRK5 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SDF4Q9BRK5 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SDF4Q9BRK5 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SDF4Q9BRK5 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SDF4Q9BRK5 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SDF4Q9BRK5 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms