Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQY4

RHOXF2, Rhox homeobox family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOXF2Q9BQY4 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RHOXF2Q9BQY4 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
RHOXF2Q9BQY4 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
RHOXF2Q9BQY4 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RHOXF2Q9BQY4 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RHOXF2Q9BQY4 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
RHOXF2Q9BQY4 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
RHOXF2Q9BQY4 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RHOXF2Q9BQY4 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RHOXF2Q9BQY4 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
RHOXF2Q9BQY4 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
RHOXF2Q9BQY4 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
RHOXF2Q9BQY4 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC20■□□□□ 0.79
RHOXF2Q9BQY4 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC20■□□□□ 0.79
RHOXF2Q9BQY4 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
RHOXF2Q9BQY4 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
RHOXF2Q9BQY4 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
RHOXF2Q9BQY4 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RHOXF2Q9BQY4 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RHOXF2Q9BQY4 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
RHOXF2Q9BQY4 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
RHOXF2Q9BQY4 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RHOXF2Q9BQY4 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RHOXF2Q9BQY4 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RHOXF2Q9BQY4 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RHOXF2Q9BQY4 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RHOXF2Q9BQY4 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RHOXF2Q9BQY4 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RHOXF2Q9BQY4 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RHOXF2Q9BQY4 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RHOXF2Q9BQY4 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RHOXF2Q9BQY4 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RHOXF2Q9BQY4 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
RHOXF2Q9BQY4 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RHOXF2Q9BQY4 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RHOXF2Q9BQY4 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RHOXF2Q9BQY4 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RHOXF2Q9BQY4 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RHOXF2Q9BQY4 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RHOXF2Q9BQY4 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RHOXF2Q9BQY4 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RHOXF2Q9BQY4 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RHOXF2Q9BQY4 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
RHOXF2Q9BQY4 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RHOXF2Q9BQY4 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RHOXF2Q9BQY4 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RHOXF2Q9BQY4 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RHOXF2Q9BQY4 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RHOXF2Q9BQY4 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RHOXF2Q9BQY4 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RHOXF2Q9BQY4 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RHOXF2Q9BQY4 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RHOXF2Q9BQY4 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RHOXF2Q9BQY4 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RHOXF2Q9BQY4 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RHOXF2Q9BQY4 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RHOXF2Q9BQY4 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RHOXF2Q9BQY4 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RHOXF2Q9BQY4 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RHOXF2Q9BQY4 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RHOXF2Q9BQY4 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RHOXF2Q9BQY4 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RHOXF2Q9BQY4 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RHOXF2Q9BQY4 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RHOXF2Q9BQY4 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RHOXF2Q9BQY4 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
RHOXF2Q9BQY4 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RHOXF2Q9BQY4 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RHOXF2Q9BQY4 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RHOXF2Q9BQY4 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RHOXF2Q9BQY4 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RHOXF2Q9BQY4 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RHOXF2Q9BQY4 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RHOXF2Q9BQY4 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RHOXF2Q9BQY4 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RHOXF2Q9BQY4 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RHOXF2Q9BQY4 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RHOXF2Q9BQY4 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RHOXF2Q9BQY4 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RHOXF2Q9BQY4 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RHOXF2Q9BQY4 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RHOXF2Q9BQY4 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RHOXF2Q9BQY4 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RHOXF2Q9BQY4 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RHOXF2Q9BQY4 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RHOXF2Q9BQY4 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
RHOXF2Q9BQY4 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RHOXF2Q9BQY4 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RHOXF2Q9BQY4 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RHOXF2Q9BQY4 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RHOXF2Q9BQY4 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RHOXF2Q9BQY4 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RHOXF2Q9BQY4 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RHOXF2Q9BQY4 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RHOXF2Q9BQY4 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
RHOXF2Q9BQY4 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RHOXF2Q9BQY4 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RHOXF2Q9BQY4 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RHOXF2Q9BQY4 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RHOXF2Q9BQY4 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms