Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ08

RETNLB, Resistin-like beta, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETNLBQ9BQ08 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
RETNLBQ9BQ08 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
RETNLBQ9BQ08 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
RETNLBQ9BQ08 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
RETNLBQ9BQ08 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
RETNLBQ9BQ08 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
RETNLBQ9BQ08 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
RETNLBQ9BQ08 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
RETNLBQ9BQ08 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC11.28□□□□□ -0.6
RETNLBQ9BQ08 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
RETNLBQ9BQ08 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
RETNLBQ9BQ08 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
RETNLBQ9BQ08 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
RETNLBQ9BQ08 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
RETNLBQ9BQ08 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
RETNLBQ9BQ08 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
RETNLBQ9BQ08 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
RETNLBQ9BQ08 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
RETNLBQ9BQ08 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
RETNLBQ9BQ08 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
RETNLBQ9BQ08 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
RETNLBQ9BQ08 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
RETNLBQ9BQ08 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
RETNLBQ9BQ08 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
RETNLBQ9BQ08 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
RETNLBQ9BQ08 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
RETNLBQ9BQ08 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
RETNLBQ9BQ08 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC11.27□□□□□ -0.6
RETNLBQ9BQ08 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
RETNLBQ9BQ08 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
RETNLBQ9BQ08 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
RETNLBQ9BQ08 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
RETNLBQ9BQ08 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
RETNLBQ9BQ08 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
RETNLBQ9BQ08 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
RETNLBQ9BQ08 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.6
RETNLBQ9BQ08 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
RETNLBQ9BQ08 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
RETNLBQ9BQ08 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC11.26□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms