Protein–RNA interactions for Protein: Q99653

CHP1, Calcineurin B homologous protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHP1Q99653 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHP1Q99653 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHP1Q99653 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHP1Q99653 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHP1Q99653 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHP1Q99653 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CHP1Q99653 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHP1Q99653 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHP1Q99653 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHP1Q99653 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHP1Q99653 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHP1Q99653 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHP1Q99653 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHP1Q99653 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHP1Q99653 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHP1Q99653 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CHP1Q99653 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHP1Q99653 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHP1Q99653 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHP1Q99653 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHP1Q99653 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHP1Q99653 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHP1Q99653 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHP1Q99653 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHP1Q99653 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHP1Q99653 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHP1Q99653 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHP1Q99653 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHP1Q99653 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHP1Q99653 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHP1Q99653 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHP1Q99653 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHP1Q99653 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHP1Q99653 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHP1Q99653 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHP1Q99653 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHP1Q99653 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHP1Q99653 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHP1Q99653 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHP1Q99653 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHP1Q99653 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHP1Q99653 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHP1Q99653 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHP1Q99653 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHP1Q99653 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHP1Q99653 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHP1Q99653 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHP1Q99653 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHP1Q99653 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHP1Q99653 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHP1Q99653 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHP1Q99653 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHP1Q99653 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHP1Q99653 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHP1Q99653 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
CHP1Q99653 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHP1Q99653 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHP1Q99653 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHP1Q99653 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHP1Q99653 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHP1Q99653 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHP1Q99653 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHP1Q99653 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHP1Q99653 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHP1Q99653 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHP1Q99653 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHP1Q99653 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHP1Q99653 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHP1Q99653 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHP1Q99653 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CHP1Q99653 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHP1Q99653 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHP1Q99653 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHP1Q99653 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CHP1Q99653 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHP1Q99653 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHP1Q99653 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHP1Q99653 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHP1Q99653 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHP1Q99653 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHP1Q99653 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHP1Q99653 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHP1Q99653 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHP1Q99653 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHP1Q99653 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHP1Q99653 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHP1Q99653 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHP1Q99653 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHP1Q99653 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHP1Q99653 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHP1Q99653 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHP1Q99653 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHP1Q99653 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHP1Q99653 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHP1Q99653 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHP1Q99653 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHP1Q99653 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHP1Q99653 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHP1Q99653 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHP1Q99653 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms