Protein–RNA interactions for Protein: Q96S82

UBL7, Ubiquitin-like protein 7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 380 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBL7Q96S82 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBL7Q96S82 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBL7Q96S82 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBL7Q96S82 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBL7Q96S82 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBL7Q96S82 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBL7Q96S82 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
UBL7Q96S82 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
UBL7Q96S82 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
UBL7Q96S82 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
UBL7Q96S82 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
UBL7Q96S82 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
UBL7Q96S82 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
UBL7Q96S82 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
UBL7Q96S82 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
UBL7Q96S82 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
UBL7Q96S82 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
UBL7Q96S82 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
UBL7Q96S82 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
UBL7Q96S82 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
UBL7Q96S82 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
UBL7Q96S82 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
UBL7Q96S82 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
UBL7Q96S82 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
UBL7Q96S82 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
UBL7Q96S82 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
UBL7Q96S82 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
UBL7Q96S82 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
UBL7Q96S82 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
UBL7Q96S82 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
UBL7Q96S82 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
UBL7Q96S82 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
UBL7Q96S82 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
UBL7Q96S82 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
UBL7Q96S82 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
UBL7Q96S82 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
UBL7Q96S82 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
UBL7Q96S82 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
UBL7Q96S82 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
UBL7Q96S82 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
UBL7Q96S82 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
UBL7Q96S82 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
UBL7Q96S82 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
UBL7Q96S82 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
UBL7Q96S82 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
UBL7Q96S82 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBL7Q96S82 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBL7Q96S82 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBL7Q96S82 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBL7Q96S82 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBL7Q96S82 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBL7Q96S82 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBL7Q96S82 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBL7Q96S82 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBL7Q96S82 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBL7Q96S82 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBL7Q96S82 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBL7Q96S82 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBL7Q96S82 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBL7Q96S82 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBL7Q96S82 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBL7Q96S82 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBL7Q96S82 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBL7Q96S82 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBL7Q96S82 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBL7Q96S82 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBL7Q96S82 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBL7Q96S82 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBL7Q96S82 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBL7Q96S82 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBL7Q96S82 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBL7Q96S82 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBL7Q96S82 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBL7Q96S82 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBL7Q96S82 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBL7Q96S82 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBL7Q96S82 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBL7Q96S82 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBL7Q96S82 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBL7Q96S82 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBL7Q96S82 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBL7Q96S82 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBL7Q96S82 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBL7Q96S82 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBL7Q96S82 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
UBL7Q96S82 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBL7Q96S82 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBL7Q96S82 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBL7Q96S82 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
UBL7Q96S82 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBL7Q96S82 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBL7Q96S82 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBL7Q96S82 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBL7Q96S82 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBL7Q96S82 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBL7Q96S82 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBL7Q96S82 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBL7Q96S82 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBL7Q96S82 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBL7Q96S82 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms