Protein–RNA interactions for Protein: Q96RK0

CIC, Protein capicua homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,608 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CICQ96RK0 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CICQ96RK0 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CICQ96RK0 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CICQ96RK0 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CICQ96RK0 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CICQ96RK0 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CICQ96RK0 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CICQ96RK0 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CICQ96RK0 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CICQ96RK0 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CICQ96RK0 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CICQ96RK0 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CICQ96RK0 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CICQ96RK0 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CICQ96RK0 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CICQ96RK0 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CICQ96RK0 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CICQ96RK0 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CICQ96RK0 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CICQ96RK0 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CICQ96RK0 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CICQ96RK0 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CICQ96RK0 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CICQ96RK0 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CICQ96RK0 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CICQ96RK0 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CICQ96RK0 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CICQ96RK0 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CICQ96RK0 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CICQ96RK0 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CICQ96RK0 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CICQ96RK0 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CICQ96RK0 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CICQ96RK0 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CICQ96RK0 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CICQ96RK0 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CICQ96RK0 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CICQ96RK0 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CICQ96RK0 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CICQ96RK0 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CICQ96RK0 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CICQ96RK0 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CICQ96RK0 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CICQ96RK0 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CICQ96RK0 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CICQ96RK0 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CICQ96RK0 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CICQ96RK0 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CICQ96RK0 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CICQ96RK0 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CICQ96RK0 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CICQ96RK0 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CICQ96RK0 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CICQ96RK0 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CICQ96RK0 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CICQ96RK0 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CICQ96RK0 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CICQ96RK0 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CICQ96RK0 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CICQ96RK0 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CICQ96RK0 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CICQ96RK0 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CICQ96RK0 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CICQ96RK0 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CICQ96RK0 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CICQ96RK0 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CICQ96RK0 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CICQ96RK0 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CICQ96RK0 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CICQ96RK0 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CICQ96RK0 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CICQ96RK0 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CICQ96RK0 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CICQ96RK0 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CICQ96RK0 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CICQ96RK0 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CICQ96RK0 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CICQ96RK0 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CICQ96RK0 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CICQ96RK0 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
CICQ96RK0 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CICQ96RK0 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CICQ96RK0 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CICQ96RK0 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CICQ96RK0 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CICQ96RK0 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CICQ96RK0 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CICQ96RK0 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CICQ96RK0 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CICQ96RK0 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CICQ96RK0 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CICQ96RK0 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CICQ96RK0 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CICQ96RK0 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CICQ96RK0 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CICQ96RK0 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CICQ96RK0 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CICQ96RK0 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CICQ96RK0 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CICQ96RK0 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms