Protein–RNA interactions for Protein: Q96QD8

SLC38A2, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A2Q96QD8 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC38A2Q96QD8 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC38A2Q96QD8 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC38A2Q96QD8 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC38A2Q96QD8 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC38A2Q96QD8 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC38A2Q96QD8 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC38A2Q96QD8 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC38A2Q96QD8 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC38A2Q96QD8 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC38A2Q96QD8 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC38A2Q96QD8 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC38A2Q96QD8 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC38A2Q96QD8 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC38A2Q96QD8 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC38A2Q96QD8 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC38A2Q96QD8 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC38A2Q96QD8 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC38A2Q96QD8 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC38A2Q96QD8 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC38A2Q96QD8 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC38A2Q96QD8 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC38A2Q96QD8 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC38A2Q96QD8 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC38A2Q96QD8 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC38A2Q96QD8 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC38A2Q96QD8 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC38A2Q96QD8 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC38A2Q96QD8 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC38A2Q96QD8 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC38A2Q96QD8 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC38A2Q96QD8 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC38A2Q96QD8 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC38A2Q96QD8 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC38A2Q96QD8 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC38A2Q96QD8 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC38A2Q96QD8 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC38A2Q96QD8 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC38A2Q96QD8 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC38A2Q96QD8 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC38A2Q96QD8 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC38A2Q96QD8 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC38A2Q96QD8 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC38A2Q96QD8 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC38A2Q96QD8 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC38A2Q96QD8 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC38A2Q96QD8 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC38A2Q96QD8 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC38A2Q96QD8 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC38A2Q96QD8 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC38A2Q96QD8 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC38A2Q96QD8 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC38A2Q96QD8 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC38A2Q96QD8 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC38A2Q96QD8 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC38A2Q96QD8 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC38A2Q96QD8 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC38A2Q96QD8 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC38A2Q96QD8 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC38A2Q96QD8 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC38A2Q96QD8 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC38A2Q96QD8 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC38A2Q96QD8 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC38A2Q96QD8 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC38A2Q96QD8 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC38A2Q96QD8 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC38A2Q96QD8 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC38A2Q96QD8 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC38A2Q96QD8 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC38A2Q96QD8 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC38A2Q96QD8 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC38A2Q96QD8 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC38A2Q96QD8 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC38A2Q96QD8 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC38A2Q96QD8 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC38A2Q96QD8 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC38A2Q96QD8 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC38A2Q96QD8 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC38A2Q96QD8 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC38A2Q96QD8 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC38A2Q96QD8 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC38A2Q96QD8 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC38A2Q96QD8 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC38A2Q96QD8 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC38A2Q96QD8 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC38A2Q96QD8 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SLC38A2Q96QD8 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SLC38A2Q96QD8 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SLC38A2Q96QD8 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SLC38A2Q96QD8 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SLC38A2Q96QD8 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SLC38A2Q96QD8 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SLC38A2Q96QD8 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SLC38A2Q96QD8 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SLC38A2Q96QD8 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SLC38A2Q96QD8 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SLC38A2Q96QD8 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SLC38A2Q96QD8 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SLC38A2Q96QD8 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SLC38A2Q96QD8 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms