Protein–RNA interactions for Protein: Q96KT6

LINC00208, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00208, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00208Q96KT6 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC10.82□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms