Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES6

MFSD3, Major facilitator superfamily domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFSD3Q96ES6 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MFSD3Q96ES6 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MFSD3Q96ES6 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MFSD3Q96ES6 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MFSD3Q96ES6 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MFSD3Q96ES6 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
MFSD3Q96ES6 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MFSD3Q96ES6 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
MFSD3Q96ES6 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MFSD3Q96ES6 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MFSD3Q96ES6 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MFSD3Q96ES6 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MFSD3Q96ES6 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MFSD3Q96ES6 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MFSD3Q96ES6 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MFSD3Q96ES6 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MFSD3Q96ES6 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MFSD3Q96ES6 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MFSD3Q96ES6 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MFSD3Q96ES6 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MFSD3Q96ES6 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MFSD3Q96ES6 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MFSD3Q96ES6 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MFSD3Q96ES6 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MFSD3Q96ES6 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MFSD3Q96ES6 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MFSD3Q96ES6 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MFSD3Q96ES6 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
MFSD3Q96ES6 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MFSD3Q96ES6 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MFSD3Q96ES6 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MFSD3Q96ES6 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MFSD3Q96ES6 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MFSD3Q96ES6 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
MFSD3Q96ES6 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
MFSD3Q96ES6 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MFSD3Q96ES6 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
MFSD3Q96ES6 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MFSD3Q96ES6 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MFSD3Q96ES6 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MFSD3Q96ES6 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MFSD3Q96ES6 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
MFSD3Q96ES6 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MFSD3Q96ES6 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MFSD3Q96ES6 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MFSD3Q96ES6 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MFSD3Q96ES6 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MFSD3Q96ES6 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MFSD3Q96ES6 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MFSD3Q96ES6 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MFSD3Q96ES6 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MFSD3Q96ES6 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MFSD3Q96ES6 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MFSD3Q96ES6 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MFSD3Q96ES6 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MFSD3Q96ES6 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MFSD3Q96ES6 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MFSD3Q96ES6 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MFSD3Q96ES6 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MFSD3Q96ES6 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MFSD3Q96ES6 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MFSD3Q96ES6 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MFSD3Q96ES6 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MFSD3Q96ES6 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MFSD3Q96ES6 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MFSD3Q96ES6 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MFSD3Q96ES6 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MFSD3Q96ES6 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MFSD3Q96ES6 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MFSD3Q96ES6 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MFSD3Q96ES6 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MFSD3Q96ES6 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MFSD3Q96ES6 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MFSD3Q96ES6 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MFSD3Q96ES6 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MFSD3Q96ES6 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MFSD3Q96ES6 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MFSD3Q96ES6 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
MFSD3Q96ES6 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
MFSD3Q96ES6 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
MFSD3Q96ES6 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
MFSD3Q96ES6 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
MFSD3Q96ES6 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
MFSD3Q96ES6 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
MFSD3Q96ES6 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
MFSD3Q96ES6 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
MFSD3Q96ES6 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
MFSD3Q96ES6 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
MFSD3Q96ES6 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
MFSD3Q96ES6 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
MFSD3Q96ES6 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
MFSD3Q96ES6 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
MFSD3Q96ES6 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
MFSD3Q96ES6 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
MFSD3Q96ES6 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
MFSD3Q96ES6 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
MFSD3Q96ES6 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MFSD3Q96ES6 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MFSD3Q96ES6 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MFSD3Q96ES6 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms